24小时热门版块排行榜    

查看: 367  |  回复: 5
当前主题已经存档。

veralee01

[交流] 【求助】用hyperchem给蛋白质分子加上一个periodic box

想用hyperchem给蛋白质分子加上一个periodic box,但是有部分分子总是落在盒子的外面,请教高手怎样把整个分子都装进盒子里呢?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

coolter2001

银虫 (小有名气)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,化学区正在举办十大“耐思”版主评选,http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527,欢迎你去投票支持计模版版主!
hyperchem里面他的模拟盒大小是有限制的
好象是56*56*56  好象是大了就不行了!!
2楼2008-06-06 09:51:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

veralee01

回复2楼

如果是因为模拟盒大小限制的话根本就加不上的,我的能装下,只是露出一点来,就想问问怎么把那露出的部分包进去。
3楼2008-06-06 10:05:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

veralee01

回复2楼

如果是因为大小限制的话模拟盒根本加不上的,我的能加上,只是分子露出一块来,怎么把露出的那块给加进去呢?
4楼2008-06-06 10:09:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

coolter2001

银虫 (小有名气)

先优化再装periodic box  试试!
5楼2008-06-06 10:45:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dongping001

木虫 (正式写手)

可以先优化一下结构;
或者把周期盒的大小变大
另外最重要的是:即使出去一部分也可以,因为它是周期性的,从一侧出去一定会在另外一侧进来,跑动力学的时候最明显
6楼2008-06-06 23:10:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 veralee01 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见