24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 175  |  回复: 1
当前主题已经存档。

tecpenguin

铁虫 (初入文坛)

[交流] 如何补充pdb文件里缺失的重原子

从PDB数据库里下载的pdb文件, 由于是从X射线衍射得到的, 因此会有一些原子丢掉,
大家是用什么软件加上这么原子。

我用ambertools加上这些原子的时候会同时加上H原子。

有用sybyl的吗, 或者其它更好的办法?
回复此楼
苦干巧干,多动脑筋,坚持原则,掌握灵活,宽以待人,严于律己,广交朋友,不要吝啬
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jilinjohn

至尊木虫 (著名写手)

你用pdbviwer看看 貌似这个可以 它 是自动加的
http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=696776&view=old
2楼2008-06-05 08:26:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 tecpenguin 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 调剂 +16 不逢春 2026-04-07 17/850 2026-04-08 00:22 by T可可西里T
[考研] 22408 266求调剂 +3 masss11222 2026-04-07 6/300 2026-04-07 23:36 by shanqishi
[考研] 307分材料专业求调剂 +9 Hll胡 2026-04-05 9/450 2026-04-07 16:41 by daiee
[考研] 285求调剂 +16 哦呦呼o 2026-04-04 16/800 2026-04-07 12:31 by 1018329917
[考研] 333求调剂 +6 合乘杨习夕 2026-04-06 6/300 2026-04-07 09:44 by 猪会飞
[考研] 071000生物学调剂 +7 拉提桃 2026-04-06 7/350 2026-04-06 18:55 by 52305043001
[考研] 求助071001调剂!!! +4 黄守松 2026-04-05 5/250 2026-04-06 10:55 by 1028907439
[考研] 0857大类环境工程B区求调剂 +3 龚禹铭 2026-04-05 3/150 2026-04-06 10:22 by 蓝云思雨
[考研] 0817化学工程与技术求调剂,一志愿中海洋319 +14 lv945 2026-04-04 14/700 2026-04-06 10:20 by 蓝云思雨
[考研] 材料专硕283求调剂 +17 试试看呗 2026-04-04 18/900 2026-04-06 09:24 by 286640313
[考研] 一志愿211,化学学硕,310分,本科重点双非,求调剂 +13 努力奋斗112 2026-04-04 13/650 2026-04-06 07:13 by jj987
[考研] 材料调剂 +13 一样YWY 2026-04-03 14/700 2026-04-05 18:20 by 蓝云思雨
[考研] 电子信息调剂交叉学科有推荐吗 +6 jhtfeybgj 2026-04-01 9/450 2026-04-05 11:13 by 猪会飞
[考研] 309求调剂 +6 刘刘刘1231 2026-04-02 7/350 2026-04-04 13:41 by liucky
[考研] 320求调剂 +5 振—TZ 2026-04-02 5/250 2026-04-03 14:42 by fxue1114
[考研] 机械专硕297 +3 Afksy 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:24 by 1753564080
[考研] 296求调剂 +4 sdhu 2026-04-02 4/200 2026-04-02 21:29 by baoball
[考研] 348求调剂 +6 吴彦祖24k 2026-04-02 6/300 2026-04-02 14:07 by 给你你注意休息
[考研] 324求调剂 +5 想上学求调 2026-04-01 6/300 2026-04-02 10:16 by sanrepian
[硕博家园] 考研调剂 +5 骆驼男人 2026-04-01 5/250 2026-04-01 14:28 by syjjj0321
信息提示
请填处理意见