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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 如何补充pdb文件里缺失的重原子
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tecpenguin

铁虫 (初入文坛)

[交流] 如何补充pdb文件里缺失的重原子

从PDB数据库里下载的pdb文件， 由于是从X射线衍射得到的， 因此会有一些原子丢掉，
大家是用什么软件加上这么原子。

我用ambertools加上这些原子的时候会同时加上H原子。

有用sybyl的吗, 或者其它更好的办法？
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苦干巧干，多动脑筋，坚持原则，掌握灵活，宽以待人，严于律己，广交朋友，不要吝啬
1楼 2008-06-04 20:39:21
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jilinjohn

至尊木虫 (著名写手)
你用pdbviwer看看 貌似这个可以 它 是自动加的
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http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=696776&view=old
2楼2008-06-05 08:26:15
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