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新虫 (初入文坛)

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专业: 药物设计与药物信息

[求助] GLOD分子模拟结果分析和参数设置

各位大神，本人初涉分子模拟领域，导师让我用GLOD进行screen和dock。以前我用过autodock进行对接，知道可以在对接完成后直接看能量数据，氢键也可以visualize，但是请问GOLD也可以进行类似操作吗？看GOLD的说明书感觉GOLDMine可以用来分析对接结果，但是要怎么样才可以把数据导入到GOLDMine进行查看？

另外请问对接时候我导入的是带有配体的蛋白分子，在delete ligand部分我extract了需要的ligand，其他的是不是默认自动删除的？（后期对接完成想把这个配体和后面对接上的配体作为比较）

如果大牛用过GOLD求交流~~
谢谢！！！

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