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生物回家

铜虫 (初入文坛)

[求助] 核酸序列的基本分析！ 已有2人参与

求助各位大牛，本人有一些ITS序列，想要进行序列经比对后的信息位点统计。包括：排列位点，保守位点，变异位点，简约信息位点，单一多态位点，A、T、C、G碱基平均含量。其中，缺失/插入位点？个；转换突变的核苷酸位点数？个；颠换突变的核苷酸位点数？个，转换/颠换？个。
“其中”前面都已经用Mega统计出来了，“其中”后面的不会算。求问：用什么软件，怎么操作？

十分感谢！
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1楼 2015-01-18 16:13:16
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红卫大兵

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2015-01-18 22:49:10
perl语言可以用来分析一些snp啥的，不过需要有参考基因序列
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2楼2015-01-18 16:40:05
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生物回家

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 红卫大兵 at 2015-01-18 16:40:05
perl语言可以用来分析一些snp啥的，不过需要有参考基因序列

昂。。。能用Mega，BioEdit或者DNAman做出来吗
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3楼2015-01-18 16:42:56
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周大熊

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

请问您怎么算的最后，有同样困惑
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4楼2018-12-05 23:11:49
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