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生物回家

铜虫 (初入文坛)

[求助] 核酸序列的基本分析! 已有2人参与

求助各位大牛,本人有一些ITS序列,想要进行序列经比对后的信息位点统计。包括:排列位点,保守位点,变异位点,简约信息位点,单一多态位点,A、T、C、G碱基平均含量。其中,缺失/插入位点?个;转换突变的核苷酸位点数?个;颠换突变的核苷酸位点数?个,转换/颠换?个。
“其中”前面都已经用Mega统计出来了,“其中”后面的不会算。求问:用什么软件,怎么操作?

十分感谢!
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红卫大兵

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2015-01-18 22:49:10
perl语言可以用来分析一些snp啥的,不过需要有参考基因序列
2楼2015-01-18 16:40:05
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生物回家

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 红卫大兵 at 2015-01-18 16:40:05
perl语言可以用来分析一些snp啥的,不过需要有参考基因序列

昂。。。能用Mega,BioEdit或者DNAman做出来吗
3楼2015-01-18 16:42:56
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周大熊

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

请问您怎么算的最后,有同样困惑
4楼2018-12-05 23:11:49
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