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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求助，关于特异引物设计
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rodickholm

木虫 (正式写手)

[交流] 求助，关于特异引物设计

RT-PCR引物设计，mRNA序列是直接复制到pp5.0就可以设计，还是转换成DNA序列再设计？如果要转换，怎么转换？
该序列的ORF已经知道，是否要将引物设计在ORF内？？？还有其他什么要注意的？请高手指教
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1楼 2008-06-02 21:08:59
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jiwu20

铜虫 (小有名气)
RT-PCR引物设计，mRNA序列是直接复制到pp5.0就可以设计，还是转换成DNA序列再设计？如果要转换，怎么转换？
Sample Text转换要好一些，不转化也行，要注意方向就可以
该序列的ORF已经知道，是否要将引物设计在ORF内？？？还有其他什么要注意的？请高手指教
Sample Text如果仅要ORF，从起始密码子及终止子一段开始设计引物
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2楼2008-06-05 09:22:37
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轻5飞扬

金虫 (正式写手)
回楼上的第二个问题,认为解答有误,如果是为了做RT的话,不可以简单认为只选头和尾,可能ORF长的话反而不好PCR,也无法说明表达的问题,所以要选取约三百到四百的较为特异的区段设计引物才好
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3楼2008-06-05 11:48:09
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