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rodickholm

木虫 (正式写手)

[交流] 求助,关于特异引物设计

RT-PCR引物设计,mRNA序列是直接复制到pp5.0就可以设计,还是转换成DNA序列再设计?如果要转换,怎么转换?
该序列的ORF已经知道,是否要将引物设计在ORF内???还有其他什么要注意的?请高手指教
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jiwu20

铜虫 (小有名气)

RT-PCR引物设计,mRNA序列是直接复制到pp5.0就可以设计,还是转换成DNA序列再设计?如果要转换,怎么转换?
Sample Text转换要好一些,不转化也行,要注意方向就可以
该序列的ORF已经知道,是否要将引物设计在ORF内???还有其他什么要注意的?请高手指教
Sample Text如果仅要ORF,从起始密码子及终止子一段开始设计引物
2楼2008-06-05 09:22:37
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轻5飞扬

金虫 (正式写手)

回楼上的第二个问题,认为解答有误,如果是为了做RT的话,不可以简单认为只选头和尾,可能ORF长的话反而不好PCR,也无法说明表达的问题,所以要选取约三百到四百的较为特异的区段设计引物才好
3楼2008-06-05 11:48:09
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