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oudegeshen

银虫 (小有名气)

[求助] Materials Studio 7.0 计算PGA(一种高分子)密度,最终目的期望得到好的PGA分子结构

维基百科数据显示PGA (poly glycolic acid) 密度1.53 g/cm^3
但我用materials studio计算的值是1.40 g/cm^3
方法:建立PGA均聚物——PGA分子,然后modify charge。一个PGA分子含30个glycolic acid 单体,一个Amorphous cell construction 的边长为31埃,计算质量为medium,5个frame.
         然后几何优化,几何优化后选择用能量最低的frame计算Forcite dynamics:NPT--298K,1.0e-4GPa,压力和温度都用Anderson,计算时间为2纳秒。
我试过几何优化后用Forcite anneal-NVT,然后再计算Forcite dynamics。但得到的密度反而更小一点。
也试过将一个PGA分子的单体数目设为100,Amorphous cell construction 的边长为40埃,然后用Forcite dynamics计算,结果密度小于1.4 g/cm^3.

还有个问题,每次建立的Amorphous construction cell 内分子分布都不均匀,而且分子间总有很大的缝隙,怎样的得到更好的结构或能量更低的结构呢?

求教高手!!

谢谢!!
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xuyihan

木虫 (正式写手)

帮顶!
同问:怎样能让PGA的密度计算结果变大?
自信,收敛,冷静,保持理性
3楼2015-01-14 00:53:48
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oudegeshen

银虫 (小有名气)

木有人吗?
2楼2015-01-11 06:44:28
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