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liuyanfeng123

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性别: MM
专业: 多环芳烃的微生物降解

[交流] 菌种16SrDNA进化树的构建！急急！！

现已有某菌种的16SrDNA序列，需对其进行菌种鉴定，构建进化树，我知道是在ncbi里面去比对，具体操作不会弄，需各位高手帮忙！！先谢谢啦～～

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1楼 2008-05-31 09:29:51

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polly84

铜虫 (小有名气)

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虫号: 446218
注册: 2007-10-29
性别: GG
专业: 植物生理与生化

★
liuyanfeng123(金币+1,VIP+0):谢谢！！你能帮我做吗？我只要鉴定到属就可以了

PCR产物测序由上海博亚生物公司完成, 获得的序列通过NCBI网站上Blast比对, 先到NCBI中blast，从GenBank选取，同源性高的序列，另外找一个具有相似性的外类群（非本属），用ClustalX（Version1.83）软件进行比对分析。用MEGA3.1软件构建系统发生树，但是楼上用16SrDNA鉴定细菌，想鉴定到种，估计比较难，因为该序列的保守性很高，估计鉴定到属是肯定可以的

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好好实验

2楼2008-05-31 12:41:43

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