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liuyanfeng123

银虫 (小有名气)

[交流] 菌种16SrDNA进化树的构建!急急!!

现已有某菌种的16SrDNA序列,需对其进行菌种鉴定,构建进化树,我知道是在ncbi里面去比对,具体操作不会弄,需各位高手帮忙!!先谢谢啦~~
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polly84

铜虫 (小有名气)


liuyanfeng123(金币+1,VIP+0):谢谢!!你能帮我做吗?我只要鉴定到属就可以了
PCR产物测序由上海博亚生物公司完成, 获得的序列通过NCBI网站上Blast比对, 先到NCBI中blast,从GenBank选取,同源性高的序列,另外找一个具有相似性的外类群(非本属),用ClustalX(Version1.83)软件进行比对分析。用MEGA3.1软件构建系统发生树,但是楼上用16SrDNA鉴定细菌,想鉴定到种,估计比较难,因为该序列的保守性很高,估计鉴定到属是肯定可以的
好好实验
2楼2008-05-31 12:41:43
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