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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 核心序列为单核苷酸的SSR标记为啥一般不用
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mungbean3881

金虫 (正式写手)

[求助] 核心序列为单核苷酸的SSR标记为啥一般不用 已有4人参与

本人开发了一系列SSR 标记，验证过程中发现核心序列为单核苷酸的可扩增率最高，多态性也不错，而多核苷酸的引物扩增效果大多不好。但是投稿以后，有审稿者质疑，说单核苷酸的SSR标记最好不用？让我选二核苷酸和三核苷酸的SSR，为啥？谢谢
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mungbean3881

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吃亏未必是祸，占便宜一定不是福
1楼 2015-01-04 17:25:44
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mungbean3881

金虫 (正式写手)
送红花一朵
请大家帮忙解答上面的问题
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吃亏未必是祸，占便宜一定不是福
2楼2015-01-04 18:47:12
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cxrjinan

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
单链和双链相比比够稳定
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3楼2015-01-04 19:33:49
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mungbean3881

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cxrjinan at 2015-01-04 19:33:49
单链和双链相比比够稳定

不是单链双链的区别，是单核苷酸重复与多核苷酸重复的区别
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吃亏未必是祸，占便宜一定不是福
4楼2015-01-04 19:36:54
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shenqingch

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2015-01-06 09:07:33
双核苷酸可以扩增出特定大小的特定片段，多核苷酸则可以扩增出多个大小特定的特异性片段，多态性应该更稳定，可重复性强。
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北京漂人
5楼2015-01-04 22:13:09
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2015-01-06 09:07:35
这么说吧，作为一个标记，只要能够稳定检测出来，有多态性，它就是一个可用的标记，编辑的意思也无可厚非，因为严格来讲，单核苷酸串联序列不应该算微卫星序列，所以叫做ssr标记有些勉强，你可以管它叫STS标记，这样编辑就不好说什么了。
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6楼2015-01-05 01:29:10
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mungbean3881

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by titus0805 at 2015-01-05 01:29:10
这么说吧，作为一个标记，只要能够稳定检测出来，有多态性，它就是一个可用的标记，编辑的意思也无可厚非，因为严格来讲，单核苷酸串联序列不应该算微卫星序列，所以叫做ssr标记有些勉强，你可以管它叫STS标记，这样 ...

谢谢指点！但是课本上明明说过微卫星序列有mono、di、tri等不同的重复单元啊？
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吃亏未必是祸，占便宜一定不是福
7楼2015-01-05 13:48:10
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jingyu501

禁虫 (正式写手)
感谢参与，应助指数 +1
本帖内容被屏蔽
8楼2015-01-05 15:30:23
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titus0805

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by mungbean3881 at 2015-01-05 13:48:10
谢谢指点！但是课本上明明说过微卫星序列有mono、di、tri等不同的重复单元啊？...

不知道你们是什么课本啊。不过这也就是一个概念的问题，不影响实质，编辑这么说了，你要么把这类去掉，要不就改个名字，别叫ssr。
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9楼2015-01-06 08:14:10
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mungbean3881

金虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by titus0805 at 2015-01-06 08:14:10
不知道你们是什么课本啊。不过这也就是一个概念的问题，不影响实质，编辑这么说了，你要么把这类去掉，要不就改个名字，别叫ssr。...

10楼2015-01-13 09:33:35
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