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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 求助，完成有丰厚报酬。
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hc8850

金虫 (初入文坛)

[求助] 求助，完成有丰厚报酬。 已有3人参与

gromacs中怎么将小分子放到大分子结构腔里
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1楼 2015-01-04 12:03:43
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hc8850

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by pymol at 2015-01-05 09:56:34
Autodock分子对接后，大小分子一块保存成pdb文件，然后跑动力学

能不能给个更清楚的步骤，我还是这方面的菜鸟。我现在的分子文件是.mol2型的，怎么做啊，，最近还有点急。
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5楼2015-01-05 15:54:07
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fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2015-01-09 10:31:58
不是吧，小分子多不多，不多直接手动添加呗
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hc8850
gromacs
2楼2015-01-04 22:53:31
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earth

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2015-01-09 10:32:03
用分子对接的方法放进去。
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hc8850
3楼2015-01-05 07:57:36
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hc8850: 金币+5, 能再给我一些具体的步骤吗？ 2015-01-05 15:54:47
Autodock分子对接后，大小分子一块保存成pdb文件，然后跑动力学
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4楼2015-01-05 09:56:34
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