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sumwindy

金虫 (正式写手)

[交流] 求助:ccdc中的看图问题

ccdc中的3D visualiser 提供的是一个分子的图,有没有办法看到grow以后的结构图(主要是为了判断是否高维结构)?
使用的版本是破解的1.3版,请虫友们多帮忙。
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

右键 packing不就可以了  或者把cif弄下来用其他软件看
2楼2008-05-28 11:36:20
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sumwindy

金虫 (正式写手)

ccdc中的packing选项只有pack 1 cell选项啊,没法子看到更多的结构。。。
3楼2008-05-28 13:31:09
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

q68(金币+0,VIP+0):欢迎常来!
pack 1 UNIT cell 吧
4楼2008-05-28 14:20:26
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alusia

金虫 (正式写手)

★ ★
q68(金币+2,VIP+0):能否具体点!
可以的。你点中所需结构后右键点view in mercury进入mercury模式后就可以实现。具体不是一两句能说好的。关键是你先要熟悉mercury的功能和使用。

[ Last edited by alusia on 2008-5-28 at 17:29 ]
思念
5楼2008-05-28 17:27:33
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sumwindy

金虫 (正式写手)

由于装了mercury1.4,使用“View in mercury"选项后,mercury报错:晶体数据库(CSD)过期。
想使用ccdc1.3自带的mercury1.0,所以卸载mercury1.4,忽然发现,“View in mercury"选项变灰,无法激活。不知道有没有虫友能帮忙解决这个问题。

另一种解决办法:查到某结构,依次选择:file->export entries as->在该窗口自上而下依次选择:CIFMIF;Current entry only;Pure cif; 选择路径;save。就可以把想要的没个结构存成cif文件,然后就随便打开了。。。。
6楼2008-05-29 10:29:25
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alusia

金虫 (正式写手)


seasedoctor(金币+1,VIP+0):谢谢你的帮助!
用自带的mercury其实可以用的,虽然再打开mercury的过程中会出现一系列错误提示,以前我用过。但是现在我的mercury选项也跟楼主说的同样原因变灰了,所以一下弄不好,也说不清。
再mercury中有一个short contact选项,构上以后再点图中的点,结构就可以一步一步的生长,适当大小以后在把short contact选项的勾去掉。就可以清楚的在mercury中看出是几维的了。如果还看不清或者说看着好像有很多分子,可以在某个原子上点右键,delete this molecule。要用好真不是一下子能说清楚的,要是能当面演示就方便多了,呵呵。关键是要多琢磨。
思念
7楼2008-05-29 16:01:17
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