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bioartist

木虫 (正式写手)

无菌草莓

[交流] 求教DNA二级结构预测方法及软件?

请问,有谁熟悉DNA的高级结构分析,如GC rich,发卡结构,回文结构,重复序列等,这方面的软件有哪些?
    不吝赐教!
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xujian568

至尊木虫 (著名写手)

Count XU

★ ★
bioartist(金币+2,VIP+0):谢谢指导!
GENERUNNER,似乎RNA STRUCTION 也可以
活着就要让人感受到你的存在。
2楼2008-05-28 16:13:03
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7961243

金虫 (正式写手)

3楼2008-05-28 16:23:29
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

在网上下载一个DOTlet软件,自己把序列添加进取后,做个自身比对。然后看图就能识别出重复序列、发卡结构、回文结构。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
4楼2008-05-28 17:42:43
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

DNAman 好像也有这个功能
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
5楼2008-05-28 17:43:07
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skkyy88888

铜虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2008-5-28 17:43:
DNAman 好像也有这个功能

有吗?
6楼2008-05-28 21:18:08
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bioartist

木虫 (正式写手)

无菌草莓

引用回帖:
Originally posted by xujian568 at 2008-5-28 16:13:
GENERUNNER,似乎RNA STRUCTION 也可以

谢谢,但是这个预测的序列好像很短啊


Error - Sequence is too long
Your sequence is longer than the Jpred limit of 800 residues. You may consider splitting your sequence into separate domains for better accuracy.
7楼2008-05-31 11:06:43
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