24小时热门版块排行榜    

查看: 124  |  回复: 2
当前主题已经存档。

红魔

金虫 (小有名气)

[交流] (急啊!)请教进化树的构建问题

若每个物种只有一个序列,我会构建物种间的进化树,但是若每个物种有多个序列(或者有的物种有多个序列而有的物种只有一个序列的情况),又怎么构建物种间的进化树?

[ Last edited by 红魔 on 2008-5-29 at 09:34 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

genomelin

银虫 (小有名气)

不太清楚你具体要做什么的,一般说来要是你不用rRNA建树的话,单个基因来做树是不太准确的,如果你能在相近物种中找到一些orthologs gene的话,可以参考Broad phylogenomic sampling improves resolution of the animal tree of life的supplementary P.25 处理你的数据
2楼2008-06-01 01:52:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

明白你的意思了,你按照下列步骤做:
将你的物种基因拿来在genbank中比对,分别作发育树;
等你选取的基因都做完时,用你建的几个发育树做对比,选择都包含这几个目的基因的物种作为种子,来建物种树。
建议:若是不同寻常的基因,可以做psi blast
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
3楼2008-06-01 09:57:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 红魔 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见