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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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准博士

金虫 (正式写手)

[交流] 如何比较同源性?

我现在在NCBI上下载了7个同种蛋白不同菌的基因,我想找到他们之间的同源关系,用什么软件,怎么用?貌似直接在NCBI的BLAST不可以吧?
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romeco

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):感谢答复
我经常用DNAstar的MegAlign 比较,好像DNAMAN也可以,
2楼2008-05-27 16:58:23
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献


准博士(金币+1,VIP+0):谢谢
呵呵,用clustalX  或者  BioEdit 吧  。在生物软件网上下载下,序列比对一下就行了。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
3楼2008-05-27 17:16:46
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boshi_1981

铁虫 (小有名气)

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):感谢答复
用clustalX  比较直观!
没有远方
4楼2008-05-27 20:11:53
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akvact

木虫 (著名写手)


准博士(金币+1,VIP+0):xiexie
使用bioedit和mega(http://www.bbioo.com/Soft/2007/459.htm)软件,做同源性比较。不过身边没人做过的话,要花些时间看教程。
讲实话和说谎一样简单,所以说实话——实验下代价如何!haha
5楼2008-05-28 10:06:46
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准博士

金虫 (正式写手)

用 clustal x 比较了,但是如何知道同源性大概百分之多少啊?
6楼2008-05-28 15:00:16
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yhs210

木虫 (著名写手)

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):感谢答复
如果序列差异性较大,建议用muscle3.6_win32软件使匹配更加准确!!
7楼2008-05-30 22:21:00
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xiaricha

银虫 (小有名气)

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):感谢答复
我一直用DNAMEN
8楼2008-06-09 21:26:36
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long76

新虫 (初入文坛)


xyklmu(金币+1,VIP+0):感谢答复
DNAMEN
很好,直接出同源性
9楼2008-07-03 15:15:57
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佳逸轩居士

金虫 (小有名气)

是  DNAMAN 
10楼2008-07-04 14:35:20
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