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准博士

金虫 (正式写手)

[交流] 如何比较同源性?

我现在在NCBI上下载了7个同种蛋白不同菌的基因,我想找到他们之间的同源关系,用什么软件,怎么用?貌似直接在NCBI的BLAST不可以吧?
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yhs210

木虫 (著名写手)

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):感谢答复
如果序列差异性较大,建议用muscle3.6_win32软件使匹配更加准确!!
7楼2008-05-30 22:21:00
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查看全部 17 个回答

romeco

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):感谢答复
我经常用DNAstar的MegAlign 比较,好像DNAMAN也可以,
2楼2008-05-27 16:58:23
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献


准博士(金币+1,VIP+0):谢谢
呵呵,用clustalX  或者  BioEdit 吧  。在生物软件网上下载下,序列比对一下就行了。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
3楼2008-05-27 17:16:46
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boshi_1981

铁虫 (小有名气)

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):感谢答复
用clustalX  比较直观!
没有远方
4楼2008-05-27 20:11:53
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