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abc6394490

铜虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】计算径向分布函数的几个问题

1、在建立晶体结构模型的时候，用了占有率来解决相同坐标位置上的冲突问题，但在计算双体分布函数时，不能分离那些设置了占有率的原子

引用回帖:

例如MgCl-LiCl2体系中Mg和一部分Li的坐标位置相同，而建模的时候设置该位置上的Mg和Li各占50%，模型中该位置上显示的是Li，但在属性中可以看到Mg和Li各占50%，计算双体分布函数时要选择体系中的不同元素，当选择Li时，他会把Mg和Li各占50%的部分也选上，选择Mg时则不能选择任何原子，这个怎么解决？

2、建立晶体结构模型后整个体系的总原子数与超胞中应该有的数量并不一致，但在Properties的Symmetry System中查看体系确实是自己想要的结构，不知道多出的是不是那些边界条件上的原子，模拟过程中这些原子也确实是必要的，但同样是在计算双体分布函数时，利用Edit->Atom Selection这些原子会被选上，对结果应该是有影响的吧？能不能去除？如果能，如何去除？

3、 Forcite模块能不能分析键角分布，Angle distribution这个是不是？相关设置在帮助文档里写的好像不是很明确，而且不知道怎么选择体系，每次计算的时候都会出错

4、做熔盐的分子动力学模拟不知道还可以利用MS计算哪些性质

[ Last edited by abc6394490 on 2008-5-29 at 14:00 ]

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1楼2008-05-27 11:45:45

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saitou

木虫 (正式写手)

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★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢

算我没说清楚：unbuild以后别再优化了，加边界优化好就该计算了。计算前去了边界再优化一次可不是要变化嘛。你不就是为了求分布函数吗，那是对当下结构有效的，即你计算完成后一个个取样的结构，哪能再优化呢。取样后原子位置都固定了，只要这个不变，分布就一定了，所以才需要把所选分子周围的空间填满（12埃以内）——用重复单元构建。

我说的“计算”是指计算分布函数，不是从优化开始的整个过程
不知这次说清楚没

[ Last edited by saitou on 2008-6-5 at 00:34 ]