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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 关于16SrDNA文库的一些疑问
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让她降落

铜虫 (正式写手)

[求助] 关于16SrDNA文库的一些疑问 已有1人参与

通过建立 16SrDNA文库能够分析细菌菌落结构，并能筛选出优势菌种。那么利用这种手段能否分析某种因素对某种细菌含量的作用。例如，能否用这种方法分析因素A对某地区中细菌B数量的影响（剔除A和加入A后细菌数量B的变化对比，假设细菌B不可被培养）。楼主看到一篇文献上说这种方法可以通过16SrDNA克隆数来反映对细菌数量的影响，但楼主的疑惑是建立16SrDNA文库不是需要扩增吗？扩增后克隆数还能与原菌落原克隆数相对应吗？
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1楼 2014-12-21 16:40:36
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让她降落

铜虫 (正式写手)
顶起来，不要沉......
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2楼2014-12-21 19:55:04
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wubingqi

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
让她降落: 金币+30, ★★★★★最佳答案 2015-06-19 09:55:48
可以的，但类似克隆文库、DGGE、T-RFLP的方法研究物种的多样性往往比较粗略，只能大体知道某个物种的丰度。如果想精确定量，用Q-pcr等方式吧。
你提取出来的是环境样品中的总DNA，PCR扩增之后是将所有的细菌都进行可扩增，还是能反应某一物种在整个环境中的大致比例的。
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3楼2014-12-22 08:21:57
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让她降落

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wubingqi at 2014-12-22 08:21:57
可以的，但类似克隆文库、DGGE、T-RFLP的方法研究物种的多样性往往比较粗略，只能大体知道某个物种的丰度。如果想精确定量，用Q-pcr等方式吧。
你提取出来的是环境样品中的总DNA，PCR扩增之后是将所有的细菌都进行 ...

你好，其实我想利用克隆文库达到两个目的：某物种B在整个环境中的比例以及因素A对物种B数量的影响。我已经知道克隆文库能反映某一物种的比例，那么在这个前提下，利用克隆文库能否确定因素A对物种B数量上的影响呢？
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4楼2014-12-22 09:34:26
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wubingqi

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 让她降落 at 2014-12-22 09:34:26
你好，其实我想利用克隆文库达到两个目的：某物种B在整个环境中的比例以及因素A对物种B数量的影响。我已经知道克隆文库能反映某一物种的比例，那么在这个前提下，利用克隆文库能否确定因素A对物种B数量上的影响呢？...

那就做2个文库了，存在因素A和不存在因素A的条件下各做一个文库，研究2个文库中物种在数量或比例上的差异。
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5楼2014-12-23 09:51:55
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