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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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让她降落

铜虫 (正式写手)

[求助] 关于16SrDNA文库的一些疑问 已有1人参与

通过建立 16SrDNA文库能够分析细菌菌落结构,并能筛选出优势菌种。那么利用这种手段能否分析某种因素对某种细菌含量的作用。例如,能否用这种方法分析因素A对某地区中细菌B数量的影响(剔除A和加入A后细菌数量B的变化对比,假设细菌B不可被培养)。楼主看到一篇文献上说这种方法可以通过16SrDNA克隆数来反映对细菌数量的影响,但楼主的疑惑是建立16SrDNA文库不是需要扩增吗?扩增后克隆数还能与原菌落原克隆数相对应吗?
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让她降落

铜虫 (正式写手)

顶起来,不要沉......
2楼2014-12-21 19:55:04
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wubingqi

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
让她降落: 金币+30, ★★★★★最佳答案 2015-06-19 09:55:48
可以的,但类似克隆文库、DGGE、T-RFLP的方法研究物种的多样性往往比较粗略,只能大体知道某个物种的丰度。如果想精确定量,用Q-pcr等方式吧。
你提取出来的是环境样品中的总DNA,PCR扩增之后是将所有的细菌都进行可扩增,还是能反应某一物种在整个环境中的大致比例的。
3楼2014-12-22 08:21:57
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让她降落

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wubingqi at 2014-12-22 08:21:57
可以的,但类似克隆文库、DGGE、T-RFLP的方法研究物种的多样性往往比较粗略,只能大体知道某个物种的丰度。如果想精确定量,用Q-pcr等方式吧。
你提取出来的是环境样品中的总DNA,PCR扩增之后是将所有的细菌都进行 ...

你好,其实我想利用克隆文库达到两个目的:某物种B在整个环境中的比例以及因素A对物种B数量的影响。我已经知道克隆文库能反映某一物种的比例,那么在这个前提下,利用克隆文库能否确定因素A对物种B数量上的影响呢?
4楼2014-12-22 09:34:26
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wubingqi

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 让她降落 at 2014-12-22 09:34:26
你好,其实我想利用克隆文库达到两个目的:某物种B在整个环境中的比例以及因素A对物种B数量的影响。我已经知道克隆文库能反映某一物种的比例,那么在这个前提下,利用克隆文库能否确定因素A对物种B数量上的影响呢?...

那就做2个文库了,存在因素A和不存在因素A的条件下各做一个文库,研究2个文库中物种在数量或比例上的差异。
5楼2014-12-23 09:51:55
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