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陈彦利

铁虫 (小有名气)

[求助] 西红柿果肉RNA提取,降解严重 已有10人参与

第一次提RNA,最近提西红柿果肉RNA,降解很严重(见图)。西红柿果肉在液氮中不好研磨,所以我直接在裂解液里研磨的,大概2~3g西红柿加3 mTRNzol试剂研磨(样品量是不是大了?),用的是天根的TRNzol 总 RNA 提取试剂盒,电泳用1%琼脂糖电泳,90V,电泳20min。上样时,好几次都是样品都飘起来,沉不下去,是不是乙醇挥发不彻底?请老师们同学们帮忙分析一下。提了很多次都这样,快崩溃了...求过来人指导!

西红柿果肉RNA提取,降解严重
20141215_095059.jpg
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陈彦利

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
18楼: Originally posted by liyuecoool at 2014-12-16 16:28:36
1.你的样品加入太多了,一般试剂盒只需要50mg-100mg样品即可,太多的话内源性的RNase太多,Trizol里的抑制剂抑制效果不完全。
2.你的电泳时间太久了,难免会分解严重。再次重复下试试,将电泳缓冲液TAE重新换制,电 ...

我按着大家的建议,重新做了一遍:
1.因为西红柿含水量太高(~90%+),所以我昨天做了一次,800 mg样品,加2.5 ml TRNzol试剂研磨。
2.离心全程4℃;
3.电泳加大了LOADING BUFFER的量(2.5 ul  buffe+5 ul  样品,上样5 ul)r,解决了样品飘起来的问题;
4.电泳缓冲液:实验室之前配好的50×TAE,稀释到1× TAE作为电泳缓冲液。
5.电泳条件:改为120 V,10 min;
结果:1.电泳条带还是一样,降解严重;  
2.Nanodrop 测得RNA浓度为~700 ng/ul,  260/280:1.60,  260/230:0.40;(之前得到的浓度一般是200 ng/ul左右)

我在考虑要不要换试剂盒,因为用别的实验室的盒子提的效果还不错!
23楼2014-12-17 11:06:23
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查看全部 54 个回答

陈彦利(金币+1): 谢谢参与


[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-12-15 15:51:43
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-12-15 18:09:10
不降解才怪,肯定不能加那么多样品的

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2014-12-15 16:48:56
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myyounger

至尊木虫 (文坛精英)

路过顺便顶一下 祝楼主一切顺利!
8楼2014-12-15 18:08:19
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