24小时热门版块排行榜    

查看: 20692  |  回复: 7

马秋瑾1992

银虫 (小有名气)

[求助] fq文件用什么软件可以打开? 已有2人参与

本人是研一新生,现在处于什么都不懂什么都不会正在努力探索的阶段,最近在学习处理数据,可是第一步就卡住了,测序回来的数据包是fq文件,不知道用什么软件可以打开?请各位前辈指导一下,非常感谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

自强不息
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
fq可以用txt打开。不过fq文件通常都比较大,G做单位比较常见,普通电脑打开直接就死机了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2014-12-15 10:46:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

马秋瑾1992

银虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-12-15 10:46:19
fq可以用txt打开。不过fq文件通常都比较大,G做单位比较常见,普通电脑打开直接就死机了。

谢谢

[ 发自小木虫客户端 ]
自强不息
3楼2014-12-15 13:42:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
马秋瑾1992: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 通过您的解答,我明白了。 2014-12-15 23:01:38
they are fastq files, you need to do several things including quality control, assembly etc. Just looking at it would not help.
4楼2014-12-15 18:17:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

马秋瑾1992

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wizardfan at 2014-12-15 18:17:52
they are fastq files, you need to do several things including quality control, assembly etc. Just looking at it would not help.

Thank you very much!
自强不息
5楼2014-12-15 23:02:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

汗神汗神

金虫 (初入文坛)

用第三方免费的文本编辑器可以打开,我用的是notepad++,要是超过它能打开的范围它会提示,这时候只能用命令行终端打开部分文件。
windows下按win+R 调出运行窗口,输入cmd按回车打开命令提示符,输入“more ”(不带引号,more后面跟一个空格),把你要看的文件拉进命令提示符窗口,按回车就可以看到了。按空格键翻页。
linux下less加上空格加上要打开的文件路径就可以打开,按上下键逐行移动。
6楼2014-12-16 12:29:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

406856929

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 汗神汗神 at 2014-12-16 12:29:51
用第三方免费的文本编辑器可以打开,我用的是notepad++,要是超过它能打开的范围它会提示,这时候只能用命令行终端打开部分文件。
windows下按win+R 调出运行窗口,输入cmd按回车打开命令提示符,输入“more ”(不 ...

怎么复制粘贴成方便查看的格式呢
7楼2015-11-22 23:20:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

汗神汗神

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 406856929 at 2015-11-22 23:20:22
怎么复制粘贴成方便查看的格式呢...

不知道你觉得方便查看的格式是什么样子的,因为fq格式每条记录由@开始,紧接着是序列的名字,然后换行,第二行是序列,接下来一行以+起头,后面可跟可不跟东西,再下一行是序列的质量值。然后就是下一个记录,继续以@开头。不知道你想要的格式是?而且是复制粘贴来的。。?

发自小木虫Android客户端
8楼2015-11-23 00:37:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 马秋瑾1992 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +3 wangyl_123 2026-10-10 6/300 2026-10-11 15:04 by Abin0406
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +3 好运来~9527 2026-10-10 5/250 2026-10-11 09:00 by 好运来~9527
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +5 13108017953 2026-10-08 5/250 2026-10-10 11:15 by wdwd123
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见