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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » fq文件用什么软件可以打开？
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马秋瑾1992

银虫 (小有名气)

[求助] fq文件用什么软件可以打开？ 已有2人参与

本人是研一新生，现在处于什么都不懂什么都不会正在努力探索的阶段，最近在学习处理数据，可是第一步就卡住了，测序回来的数据包是fq文件，不知道用什么软件可以打开？请各位前辈指导一下，非常感谢！
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自强不息
1楼 2014-12-13 23:49:28
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
fq可以用txt打开。不过fq文件通常都比较大，G做单位比较常见，普通电脑打开直接就死机了。
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

马秋瑾1992
2楼2014-12-15 10:46:19
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马秋瑾1992

银虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-12-15 10:46:19
fq可以用txt打开。不过fq文件通常都比较大，G做单位比较常见，普通电脑打开直接就死机了。

谢谢

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自强不息
3楼2014-12-15 13:42:38
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
马秋瑾1992: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 通过您的解答，我明白了。 2014-12-15 23:01:38
they are fastq files, you need to do several things including quality control, assembly etc. Just looking at it would not help.
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4楼2014-12-15 18:17:52
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马秋瑾1992

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wizardfan at 2014-12-15 18:17:52
they are fastq files, you need to do several things including quality control, assembly etc. Just looking at it would not help.

Thank you very much!
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自强不息
5楼2014-12-15 23:02:03
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汗神汗神

金虫 (初入文坛)
用第三方免费的文本编辑器可以打开，我用的是notepad++，要是超过它能打开的范围它会提示，这时候只能用命令行终端打开部分文件。
windows下按win+R 调出运行窗口，输入cmd按回车打开命令提示符，输入“more ”（不带引号，more后面跟一个空格），把你要看的文件拉进命令提示符窗口，按回车就可以看到了。按空格键翻页。
linux下less加上空格加上要打开的文件路径就可以打开，按上下键逐行移动。
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6楼2014-12-16 12:29:51
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406856929

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 汗神汗神 at 2014-12-16 12:29:51
用第三方免费的文本编辑器可以打开，我用的是notepad++，要是超过它能打开的范围它会提示，这时候只能用命令行终端打开部分文件。
windows下按win+R 调出运行窗口，输入cmd按回车打开命令提示符，输入“more ”（不 ...

怎么复制粘贴成方便查看的格式呢
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7楼2015-11-22 23:20:22
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汗神汗神

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 406856929 at 2015-11-22 23:20:22
怎么复制粘贴成方便查看的格式呢...

不知道你觉得方便查看的格式是什么样子的，因为fq格式每条记录由@开始，紧接着是序列的名字，然后换行，第二行是序列，接下来一行以+起头，后面可跟可不跟东西，再下一行是序列的质量值。然后就是下一个记录，继续以@开头。不知道你想要的格式是？而且是复制粘贴来的。。？

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8楼2015-11-23 00:37:29
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