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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 【求助】计算径向分布函数和配位数的小程序
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suny2005

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】计算径向分布函数和配位数的小程序

我现在想用CPMD做动力学计算，可是不会用它进行结果分析。在CPMD中，怎样通过分析轨迹文件得到径向分布函数和配位数？还请大侠们多多指点！或是谁有计算径向分布函数和配位数的小程序还请分享一下！谢谢！
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1楼 2008-05-21 09:22:51
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tpp001

金虫 (著名写手)
来 帮你顶啦
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迷茫在知识的海洋里，需要你的指导。thankyou
2楼2008-05-21 16:35:25
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abinitio

版主 (著名写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
帮你顶一下。
不过，貌似VMD可以分析吧
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3楼2008-05-21 16:56:21
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎继续关注计算模拟版！
太多了 一般的MD程序都有相应的后处理程序 RDF是必不可少的
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4楼2008-05-22 12:43:09
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xiaosy567

铁杆木虫 (正式写手)
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎继续关注计算模拟版！
用VMD可以可以的。同时还可以计算其他的一些参数。
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5楼2008-05-22 15:22:30
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36du

银虫 (正式写手)
偶也想算配位数和径向分布,不知从何着手啊,一窍不通,那位有些入门资料可否提供一下看看,先谢过了啊.
我的邮箱xuxiaona_1229@163.com
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6楼2008-05-22 21:49:01
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suny2005

木虫 (小有名气)
谢谢大家帮忙！我已经在VMD中找到了计算径向分布函数的窗口，可是不会设置里面的选项。



请大家指点一下，我要计算径向分布函数，在这个窗口中都应该设置哪个选项？或是学习什么材料可以明白如何设置？
还有VMD可以做空间分布函数图吗？我在VMD上没找到相应选项。

还请会用VMD的大侠们多多指点！

[ Last edited by suny2005 on 2008-5-23 at 09:19 ]
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7楼2008-05-23 08:48:54
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