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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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suny2005

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】计算径向分布函数和配位数的小程序

我现在想用CPMD做动力学计算,可是不会用它进行结果分析。在CPMD中,怎样通过分析轨迹文件得到径向分布函数和配位数?还请大侠们多多指点!或是谁有计算径向分布函数和配位数的小程序还请分享一下!谢谢!
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tpp001

金虫 (著名写手)

来 帮你顶啦
迷茫在知识的海洋里,需要你的指导。thankyou
2楼2008-05-21 16:35:25
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abinitio

版主 (著名写手)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
帮你顶一下。
不过,貌似VMD可以分析吧
3楼2008-05-21 16:56:21
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算模拟版!
太多了 一般的MD程序都有相应的后处理程序 RDF是必不可少的
4楼2008-05-22 12:43:09
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xiaosy567

铁杆木虫 (正式写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算模拟版!
用VMD可以可以的。同时还可以计算其他的一些参数。
5楼2008-05-22 15:22:30
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36du

银虫 (正式写手)

偶也想算配位数和径向分布,不知从何着手啊,一窍不通,那位有些入门资料可否提供一下看看,先谢过了啊.
我的邮箱xuxiaona_1229@163.com
6楼2008-05-22 21:49:01
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suny2005

木虫 (小有名气)

谢谢大家帮忙!我已经在VMD中找到了计算径向分布函数的窗口,可是不会设置里面的选项。



请大家指点一下,我要计算径向分布函数,在这个窗口中都应该设置哪个选项?或是学习什么材料可以明白如何设置?
还有VMD可以做空间分布函数图吗?我在VMD上没找到相应选项。

还请会用VMD的大侠们多多指点!

[ Last edited by suny2005 on 2008-5-23 at 09:19 ]
7楼2008-05-23 08:48:54
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