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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

[交流] [求助]有谁有PDB库的帮助或说明一类的东西

如题,看不太懂啊这个库。

关键我现在遇到的问题是我想搜出一个蛋白质配体复合物出来分析,比如说ACE血管紧张素转化酶的,我怎么从搜索结果看出他是一个受体-配体复合物?

谢谢指教!
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luai071

木虫 (著名写手)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
引用回帖:
Originally posted by gwdavid at 2008-5-20 10:50:


这位兄长,能不能再问您一下,我下到了类似这种complexes的复合物,进入软件里要将他们unmerge,可是太乱了,根本看不出来配体在哪啊?这个怎么看配体的位置啊?

一般非蛋白质原子著录时用“HET ATOM”标识,如果你用3D分子看图软件,那么借助这个标识就很容易确定哪个是配体。
8楼2008-05-21 09:50:05
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luai071

木虫 (著名写手)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算模拟版!
这是PDB文件详细著录说明。
2楼2008-05-20 09:42:59
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luai071

木虫 (著名写手)

其实从标题就可以看出来的,比如***complexed with &&等
3楼2008-05-20 09:44:25
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

引用回帖:
Originally posted by luai071 at 2008-5-20 09:42:
这是PDB文件详细著录说明。

真的非常非常感谢您!
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
4楼2008-05-20 10:48:16
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