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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » [求助]有谁有PDB库的帮助或说明一类的东西
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

[交流] [求助]有谁有PDB库的帮助或说明一类的东西

如题，看不太懂啊这个库。

关键我现在遇到的问题是我想搜出一个蛋白质配体复合物出来分析，比如说ACE血管紧张素转化酶的，我怎么从搜索结果看出他是一个受体－配体复合物？

谢谢指教！
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个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
1楼 2008-05-20 08:50:33
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luai071

木虫 (著名写手)
★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎继续关注计算模拟版！
这是PDB文件详细著录说明。
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2楼2008-05-20 09:42:59
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luai071

木虫 (著名写手)
其实从标题就可以看出来的，比如***complexed with &&等
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3楼2008-05-20 09:44:25
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
引用回帖:
Originally posted by luai071 at 2008-5-20 09:42:
这是PDB文件详细著录说明。

真的非常非常感谢您！
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4楼2008-05-20 10:48:16
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
引用回帖:
Originally posted by luai071 at 2008-5-20 09:44:
其实从标题就可以看出来的，比如***complexed with &&等

这位兄长，能不能再问您一下，我下到了类似这种complexes的复合物，进入软件里要将他们unmerge,可是太乱了，根本看不出来配体在哪啊？这个怎么看配体的位置啊？
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5楼2008-05-20 10:50:25
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匿名

用户注销 (小有名气)
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎继续关注计算模拟版！
本帖仅楼主可见
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6楼2008-05-20 13:58:32
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dyang0219

金虫 (小有名气)
lei0736(金币+0,VIP+0):到处都看见你发帖 请勿灌水或搭车求助
求一篇关于计算化学的外文文献
老师布置了作业，要求翻译一篇关于计算化学的外文文献，并写看法和体会。
要著名数据库，期刊名，卷，页数。
谢谢了 我的邮箱是080130219@163.com
对不起 我发不了新帖 只能发这了
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7楼2008-05-20 15:03:02
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luai071

木虫 (著名写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
引用回帖:
Originally posted by gwdavid at 2008-5-20 10:50:


这位兄长，能不能再问您一下，我下到了类似这种complexes的复合物，进入软件里要将他们unmerge,可是太乱了，根本看不出来配体在哪啊？这个怎么看配体的位置啊？

一般非蛋白质原子著录时用“HET ATOM”标识，如果你用3D分子看图软件，那么借助这个标识就很容易确定哪个是配体。
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8楼2008-05-21 09:50:05
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
明白了，非常感谢！
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9楼2008-05-21 14:53:42
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xzszhgd

铁虫 (初入文坛)
pdb文件的详细说明，太好了
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10楼2008-06-10 08:19:49
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