24小时热门版块排行榜    

查看: 780  |  回复: 1

tyssave

金虫 (小有名气)

[交流] permut的格式输入解答 已有1人参与

大家好,本人做系统进化方面研究的时候,刚开始也是找不到人,群里问了好多,都不搭理,很纳闷不知为什么这些大侠不肯把知道的东西说出来让我们学习一下,后来才找到一位师兄给指导了一下,但依然不知道该如何系统的学习,所以本人深知系统进化方面软件没人指导的痛苦,由于本人暂时不做系统进化方面的研究了,之前软件的用法也忘得差不多了,本人就把permut的输入格式代表了哪些在此写一下,我也属于半路出家,有些地方可能不准确,希望懂的大侠们能大方一点的告知我们这些菜鸟。
permut里面,依照软件里自带的例子,不同的数字分别代表变异位点的碱基,A用1 ,G用2,T用3,C用4, 插入缺失为6或9;一行代表一个单倍型,列就是有多少个变异位点;就是说一共只会有5种变异ATCG和缺失;如果列的位数对不齐,随便找一个1到4的数字代替就行了。
哪里有问题还请懂的人指出来,别让我误人子弟啊
真心希望能通过小木虫这个平台让我们大家一同学习,一起进步,希望有些大侠们在知道别人所渴望知道的知识的时候能共享一下。
回复此楼
Stuart
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenfurong18

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
可否救济一下permut软件,刚做系统进化方面研究,求指点啊!!!感谢!!!
2楼2018-05-02 20:16:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 tyssave 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +7 十三加油 2026-03-21 7/350 2026-03-23 23:48 by 热情沙漠
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +7 vv迷 2026-03-22 7/350 2026-03-23 23:44 by Txy@872106
[考研] 327求调剂 +5 prayer13 2026-03-23 5/250 2026-03-23 22:11 by 星空星月
[考研] 336化工调剂 +4 王大坦1 2026-03-23 5/250 2026-03-23 18:32 by allen-yin
[考研] 333求调剂 +6 87639 2026-03-21 10/500 2026-03-23 10:41 by Iveryant
[考研] 287求调剂 +8 晨昏线与星海 2026-03-19 9/450 2026-03-22 17:01 by i_cooler
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:46 by ColorlessPI
[考研] 318求调剂 +4 plum李子 2026-03-21 7/350 2026-03-22 14:17 by ColorlessPI
[考研] 286求调剂 +10 Faune 2026-03-21 10/500 2026-03-21 23:34 by 314126402
[考研] 初试 317 +7 半拉月丙 2026-03-20 7/350 2026-03-21 22:26 by peike
[考研] 材料学硕333求调剂 +3 北道巷 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:17 by 学员8dgXkO
[考研] 313求调剂 +4 肆叁贰壹22 2026-03-19 4/200 2026-03-21 17:33 by ColorlessPI
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-18 3/150 2026-03-21 17:31 by ColorlessPI
[考研] 一志愿华中科技大学,080502,354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武汉理工材料工程专硕调剂 +9 Doleres 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:36 by JourneyLucky
[考研] 288求调剂 +16 于海海海海 2026-03-19 16/800 2026-03-20 22:28 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +4 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:15 by JourneyLucky
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +22 rare12345 2026-03-18 22/1100 2026-03-20 20:39 by zhukairuo
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[考研] 086500 325 求调剂 +3 领带小熊 2026-03-19 3/150 2026-03-20 18:38 by 尽舜尧1
信息提示
请填处理意见