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tyssave

金虫 (小有名气)

[交流] permut的格式输入解答 已有1人参与

大家好,本人做系统进化方面研究的时候,刚开始也是找不到人,群里问了好多,都不搭理,很纳闷不知为什么这些大侠不肯把知道的东西说出来让我们学习一下,后来才找到一位师兄给指导了一下,但依然不知道该如何系统的学习,所以本人深知系统进化方面软件没人指导的痛苦,由于本人暂时不做系统进化方面的研究了,之前软件的用法也忘得差不多了,本人就把permut的输入格式代表了哪些在此写一下,我也属于半路出家,有些地方可能不准确,希望懂的大侠们能大方一点的告知我们这些菜鸟。
permut里面,依照软件里自带的例子,不同的数字分别代表变异位点的碱基,A用1 ,G用2,T用3,C用4, 插入缺失为6或9;一行代表一个单倍型,列就是有多少个变异位点;就是说一共只会有5种变异ATCG和缺失;如果列的位数对不齐,随便找一个1到4的数字代替就行了。
哪里有问题还请懂的人指出来,别让我误人子弟啊
真心希望能通过小木虫这个平台让我们大家一同学习,一起进步,希望有些大侠们在知道别人所渴望知道的知识的时候能共享一下。
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Stuart
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chenfurong18

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
可否救济一下permut软件,刚做系统进化方面研究,求指点啊!!!感谢!!!
2楼2018-05-02 20:16:42
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