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baiheichaye

新虫 (初入文坛)

[求助] 小麦QTL定位 已有3人参与

老板给我开了个新课题,让做小麦QTL定位,现在有一些问题想向大神们请教
1、采用分子标记法跑出的多态性条带一般大小区间是多少bp?
2、跑出的多态性条带进行遗传作图是定位到遗传连锁群还是定位到具体染色体上,如果是染色体上的话,原理是什么?


求大神指导
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板桥老农

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

这个还真挺不好回答
2楼2015-01-05 16:20:56
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xingge

铁虫 (小有名气)

给你一个建议,多看一些小麦QTL定位的学位论文,对你做实验有好处,回答你一个个问题,你没有说清楚你跑的分子标记是什么,现在一般都是SSR、EST和根据基因开发的功能标记,一般这些标记都有一个主带,100bp-1Kb的都有,亲本间有差异就去群体上验证即可。第二个问题,一般遗传作图都是划分遗传连锁群,根据前人定位标记定位结果在归到具体染色体上,再靠谱点儿就用连锁群上的标记做染色体物理定位,一般很少人这么做。
一切皆有可能
3楼2015-01-07 11:18:08
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tigerkevin

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xingge at 2015-01-07 11:18:08
给你一个建议,多看一些小麦QTL定位的学位论文,对你做实验有好处,回答你一个个问题,你没有说清楚你跑的分子标记是什么,现在一般都是SSR、EST和根据基因开发的功能标记,一般这些标记都有一个主带,100bp-1Kb的都 ...

我问一下,如果一组数据符合正态分布,qtl不一定能做出来,是么?
4楼2015-03-06 15:06:48
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zzyleo

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你好!本人刚刚共享了两篇文献,搜索一下,可以下载看看,希望对你有帮助。
《植物分子标记原理与方法》里面有关于QTL研究的原理和方法;
《morlecular genetic approaches to maize improvement》以玉米QTL研究为实例(全英文的,静下心看看,对研究会有很大帮助的)。
自己研究吧,会有很大提高!
5楼2015-03-16 21:48:36
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yanmou

木虫 (正式写手)

cc

【答案】应助回帖

多态性条带,是根据你的标记类型的不同而不同。现在开始做SNP芯片了,就不用跑标记了。
标记的大多数类型已经定位到小麦染色体上。
hurry up
6楼2015-04-14 18:34:27
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