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西柚

银虫 (初入文坛)

[求助] 构另一个单倍型的重组质粒 一直构不好

我有一个质粒一直构不出来。它的另一个单倍型质粒已经构好。
外源目的片段有500bp。用的载体是pGL3-promoter ,酶切位点是 xho1和kpn1。
酶切反应:  Buffer: 5ul     PCR product/ pGL3-promoter  5000ng     kpn1 5ul    xho1 5ul    水补足到50ul。 酶切后的 pGL3-promoter进行sap处理 。跑胶回收后酶连,22度,过夜。酶连时,外源目的片段与载体的摩尔比是4:1。
用的酶都是thermo的。但是挑的单克隆都是空载体   做了不下五次 ,扩目的片段的引物也重新设计过一次,也换过酶切位点,都是空载体。扩的目的片段,我送去测序,没问题,载体也是切开的。最让人费解的是它的另一个单倍型我一次就构好了,两个单倍型有15个snp位点,我设计的酶切位点和引物是避开了这15个snp位点的。目的片段就是连不进去
请高手赐教 !
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