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51541489金虫 (小有名气)
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qPCR验证目的基因在未知基因组序列材料中的问题！ 已有1人参与
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我想在我的植物材料里用qPCR验证一个目的基因在不同处理条件下的表达情况，目的基因已知但此前未见报道从我的植物材料里克隆过（我做的植物材料也没有全基因组测过序，是个小物种），我用该基因的名字和我研究的物种的名字在NCBI里搜索核酸数据库，找到2个mRNA sequence信息但都不是目的基因的明确序列，都是显示“"similar to 目的基因”。如果是这样的情况，我能用这两个序列信息加上其他近源物种该基因的序列信息一起找保守区设计兼并引物做qPCR扩增保守区段，然后结果就解释说是我的目的基因的表达情况吗？ 还是说必须先得在我的植物材料里RACE克隆出该基因，再来对克隆出的目的基因进行qPCR试验呢？ 我只是想看看表达情况，暂时不想克隆（没条件）它，但我不知道这样做qPCR结果合理不合理。 按理说是用目的基因的保守区来进行的qPCR，结果能解释成就是该目的基因的表达量吧，但是这个基因没有在我的植物材料里被克隆过，我不知道将来写文章这样解释对不对。 |
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2楼2015-10-19 15:04:03