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xf-thermal

新虫 (初入文坛)

[求助] 利用MS的CASTEP模块优化碳纳米管结构,为什么总是报错! 已有4人参与

刚刚学习CASTEP的使用,想计算碳纳米管的声子色散关系和态密度
(1)请问碳纳米管建立方面除了周期性,还有别的要求吗?
(2)如果碳纳米管没有要求,在优化结构时总是报错,请问参数都是如何设置的,为什么明明显示优化结束,但能量却不是收敛,尝试了很多参数的修改都不成功
(3)在最后点了run以后,会出现让你选择是否提高对称性的问题,选择yes会计算下去,但是运行到一半提示优化成果,但能量不收敛。选择no的话,直接运行一会儿就提示优化失败。
    这个问题困扰了好久,还望高手不吝赐教,非常感谢!!!

利用MS的CASTEP模块优化碳纳米管结构,为什么总是报错!
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利用MS的CASTEP模块优化碳纳米管结构,为什么总是报错!-1
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利用MS的CASTEP模块优化碳纳米管结构,为什么总是报错!-2
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利用MS的CASTEP模块优化碳纳米管结构,为什么总是报错!-3
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利用MS的CASTEP模块优化碳纳米管结构,为什么总是报错!-4
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z123h456

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
ljw4010: 金币+1, 谢谢交流! 2014-11-20 20:47:25
这个对话框是问你是否保留现在的结构对称性,我感觉一般都选No
8楼2014-11-20 09:23:58
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xf-thermal

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by liaoren5 at 2014-11-20 08:28:58
如果单胞12个原子,那么有可能是3,3或者3,0的碳纳米管,那么碳纳米管半径太小,从而应力太大,结构不稳定,可能导致不收敛
而你的参数设置精度比较低,也可能有问题
还有你给出的信息提示不是报错的提示,没法看是 ...

我感觉也是碳管模型的问题,我刚刚看了下,他错误里面确实提示了;
另外我想算色散关系和态密度,CASTEP模块合适么?
****************************************************************************
  Warning: electronic minimisation did not converge when finding ground state.
  ****************************************************************************

Writing model to SWNT.check
Error in geom_get_forces - electronic_minimisation of current_cell failed
Current trace stack:
geom_get_forces
geom_BFGS
geometry_optimise
castep
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0
10楼2014-11-20 09:35:02
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普通回帖

xf-thermal

新虫 (初入文坛)

为什么没有人回复,高手能不能帮帮我,参数设置如图显示了
2楼2014-11-17 21:55:53
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迷茫小白兔

银虫 (小有名气)

我也是初学CASTEP,不知道对不对哈~CASTEP里搭建一个单胞,会认为这个结构是向xyz三个方向周期性重复的,楼主确定碳纳米管是这样的结构么,别的文献里是用CASTEP还是Dmol3之类的功能算的呢?如果单胞里原子数太多,结构对称性太低,然后计算又是在自己的笔记本电脑上进行的话,有可能会不能收敛,我感觉就是因为笔记本做不了这么大量的计算,还有,楼主下次给CASTEP calculation窗口截图的时候,要把你的模型放在最前边,这样才能显示出正确的参数~~
3楼2014-11-18 10:15:59
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xf-thermal

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 迷茫小白兔 at 2014-11-18 10:15:59
我也是初学CASTEP,不知道对不对哈~CASTEP里搭建一个单胞,会认为这个结构是向xyz三个方向周期性重复的,楼主确定碳纳米管是这样的结构么,别的文献里是用CASTEP还是Dmol3之类的功能算的呢?如果单胞里原子数太多, ...

谢谢你的回复啦~我是用服务器算的,计算量应该可以满足了,关于这个对称性的问题,我确实比较模糊,我建立的单胞是12个原子。我想问下您有没有做过类似的计算,因为我现在找不到原因呢,也没有找到相关文献的计算,如果您有的话,能否分享呢,非常感谢。
4楼2014-11-18 19:56:00
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七夜听雪

铜虫 (初入文坛)

感谢参与,应助指数 +1
ljw4010: 应助指数-1, 回帖内容不能构成应助 2014-11-20 20:47:00
你发的那个不是错好吧,你自己翻译下那个英文是什么意思,,
5楼2014-11-19 13:34:16
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liaoren5

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ljw4010: 金币+2, 谢谢解答! 2014-11-20 20:47:15
如果单胞12个原子,那么有可能是3,3或者3,0的碳纳米管,那么碳纳米管半径太小,从而应力太大,结构不稳定,可能导致不收敛
而你的参数设置精度比较低,也可能有问题
还有你给出的信息提示不是报错的提示,没法看是啥错,而且你这个提示应该是点run计算时给的提示,问你要不要加对称性来计算

同时方法及泛函选择推荐GGA PBE
应用模块CASTEP的计算会比较慢,DMOL3比较快,但是不知道你算什么性质,不同的性质有些模块适合有些不适合

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

6楼2014-11-20 08:28:58
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xf-thermal

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 七夜听雪 at 2014-11-19 13:34:16
你发的那个不是错好吧,你自己翻译下那个英文是什么意思,,

谢谢你的回复啦,我知道那个不是错,我只是想知道为什么总会提示我对称性的问题~
7楼2014-11-20 09:09:31
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liaoren5

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by xf-thermal at 2014-11-20 09:09:31
谢谢你的回复啦,我知道那个不是错,我只是想知道为什么总会提示我对称性的问题~...

那只是个善意的提示,就是说加对称性计算会快,不加对称性一样可以算
9楼2014-11-20 09:24:32
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