应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 紧急求助气液界面对称模型提取径向分布函数不趋近于1如何处理
91/1返回列表
查看: 2143  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

jijing1990

金虫 (小有名气)

[求助] 紧急求助气液界面对称模型提取径向分布函数不趋近于1如何处理 已有2人参与

Shiling Yuan等人在《Molecular Dynamic Study of Alkyl Benzene Sulfonate at Air/Water Interface: Effect of Inorganic Salts》(http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp907438x)
一文中提取的头基和离子以及头基和水分子的径向分布函数均趋近于1，但我采用MS软件建立气液界面对称模型提取的两种径向分布函数都是趋近于2的，这个要怎么处理，是否有其它文献也获得这样的结果，或是要对函数径向归一化，具体如何操作？

紧急求助气液界面对称模型提取径向分布函数不趋近于1如何处理
QQ截图20141113155350.png

[ Last edited by abinitio on 2014-11-13 at 17:01 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2014-11-13 15:56:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)
是ms软件中的模块计算rdf所得到的结果趋近于2吗？？
感觉这是不可能发生的事情。
赞一下 回复此楼
2楼2014-11-13 17:08:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jijing1990

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2014-11-13 17:08:05
是ms软件中的模块计算rdf所得到的结果趋近于2吗？？
感觉这是不可能发生的事情。

我算完了确实是趋近于2的
赞一下 回复此楼
3楼2014-11-13 19:42:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jijing1990: 金币+10, ★有帮助 2014-12-04 09:59:39
关键是你要弄明白自己在“统计配对”时是否有遗漏或重复，要是有遗漏的话要通过归一化方法处理，要是重复统计那就要把多余通过归一化方法剔除，关键是自己要理解其意义，能够进行合理的分析，理论上讲要归一，但是有些文献不做这样的处理，关键是自己要给出合理的解释——物理意义。
赞一下 回复此楼
4楼2014-11-13 20:49:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jijing1990

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by chuntao118 at 2014-11-13 20:49:36
关键是你要弄明白自己在“统计配对”时是否有遗漏或重复，要是有遗漏的话要通过归一化方法处理，要是重复统计那就要把多余通过归一化方法剔除，关键是自己要理解其意义，能够进行合理的分析，理论上讲要归一，但是有 ...

不是很明白，统计配对是不是就是set的设定，这里是做的表面活性剂/水/表面活性剂的对称模型。在设定set时，是把所有的头基和水分子都选定了，算是重复统计吗，归一化要怎么处理呢
赞一下 回复此楼
5楼2014-11-13 21:28:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jijing1990: 金币+10, ★有帮助 2014-12-04 09:59:59
气－液界面是一个anisotropic的体系，这种情况下三维的rdf的归一化会跟isotropic的体系不一样，一般需要自己编程进行处理，我估计MS中计算rdf的模块只是针对isotropic的体系，所以得到的rdf在远距离处会不为1.
赞一下 回复此楼
6楼2014-11-14 01:38:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
从你的图来看，貌似是趋近于1的呀
赞一下 回复此楼
7楼2014-11-16 17:25:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jijing1990

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 赵红霞 at 2014-11-16 17:25:36
从你的图来看，貌似是趋近于1的呀

给的图不是我做的，是文献中的，我只是用来举例用的，我做的是趋近于2的。
紧急求助气液界面对称模型提取径向分布函数不趋近于1如何处理-1
QQ截图20141117110700.png
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

18245693565
8楼2014-11-17 11:07:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18245693565

铁虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by jijing1990 at 2014-11-17 11:07:40
给的图不是我做的，是文献中的，我只是用来举例用的，我做的是趋近于2的。

QQ截图20141117110700.png
...

楼主，请问问题解决了吗？

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
9楼2017-06-20 21:53:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jijing1990 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 申博发邮件 +4 Lmengk 2026-09-15 4/200 2026-09-16 00:05 by 木心想继续深造
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 3/150 2026-09-15 20:59 by zNcEhTcH7ihq
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 3/150 2026-09-15 19:50 by CgyNCDVNhGVg
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 0pYnUiPDfdnk 2026-09-14 3/150 2026-09-15 19:35 by CgyNCDVNhGVg
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 23jxep3nCNZb 2026-09-14 4/200 2026-09-15 18:11 by CgyNCDVNhGVg
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-15 16:15 by CgyNCDVNhGVg
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 3/150 2026-09-15 15:27 by CgyNCDVNhGVg
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-15 14:58 by CgyNCDVNhGVg
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-15 14:50 by VMDqgnlKimtZ
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 7/350 2026-09-15 14:49 by VMDqgnlKimtZ
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 14:38 by VMDqgnlKimtZ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-15 14:14 by VMDqgnlKimtZ
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-15 14:02 by VMDqgnlKimtZ
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-15 07:02 by 5BDX0d0WFp7t
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-15 06:01 by 5BDX0d0WFp7t
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:50 by 5BDX0d0WFp7t
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-14 23:24 by vZfe6xYu34yj
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-14 23:13 by vZfe6xYu34yj
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:25 by vZfe6xYu34yj
[找工作] 浙江师范大学是怎么坑我的 +6 recruit123 2026-09-09 6/300 2026-09-14 12:00 by 萨仁其其格
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭