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sunny_pl0911

铜虫 (初入文坛)

[求助] 有关差异蛋白组的问题,求大神帮助!!! 已有3人参与

小女子新虫一枚,从没接触过蛋白组相关的知识,最近想在原来的实验基础上进行差异蛋白组的试验,求大神给一条明路。我以前的试验是关于黄瓜的逆境生理,我的问题是:
    1、有关差异蛋白组的试验从哪里开展?是否用iTRAQ就可以得到相关的差异蛋白的信息?
    2、找到差异蛋白之后如何进行更深入的研究?
    3、能否推荐几篇国际上最新的有关作物逆境差异蛋白组研究的文章?
    不胜感激,小女子在这里叩谢了!
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Doctor V.
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馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

双向早就过时了,又贵又麻烦又不准

做iTRAQ是目前初步筛选蛋白差异的金标准

你看文章不一定要看逆境的,iTRAQ的思路是差不多的

实验分组设计和数据质量比较重要,得到好的数据后面才好分析

一直都是做质谱的,有问题可以小木虫上找我~
11楼2015-10-16 11:54:45
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七夕小巫

金虫 (小有名气)

你好,iTRAQ是做差异蛋白的经典方法。这一步是发现差异蛋白,然后做个验证,用与iTRAQ正交的方法,比如werstern,MRM, 或者PCR都行,证明确实是表达有差异,然后再做功能学的实验。没做过植物的研究,这个就不好多说了。给个邮箱,我发你一篇个人觉得还算经典的逆境蛋白组学的综述。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2014-12-01 14:35:48
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sunny_pl0911

铜虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 七夕小巫 at 2014-12-01 14:35:48
你好,iTRAQ是做差异蛋白的经典方法。这一步是发现差异蛋白,然后做个验证,用与iTRAQ正交的方法,比如werstern,MRM, 或者PCR都行,证明确实是表达有差异,然后再做功能学的实验。没做过植物的研究,这个就不好多说 ...

不知道怎么回事儿,今天才看到回复,太不好意思了,我的邮箱是:baby_pl0911@163.com,不知能否再给我发一下,万分感谢!
Doctor V.
3楼2015-06-24 09:22:23
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ganfucell

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你好:
1、差异蛋白质组要从双向电泳开始,比较经典的有国内北京六一产的、进口伯乐Bio-Rad.
2、双向电泳是找差异蛋白的,找到差异蛋白后要进行质谱分析,确定差异蛋白是什么,判定此蛋白与你的胁迫的关系;也可进一步进行基因研究。
3、文章很多,很好找,上国际网站查一下就行。
理想爱情事业
4楼2015-06-24 13:30:03
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