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gamma337

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Andersen调压

在分子动力学模拟中,有个Andersen Barostat,其中要设置质量参数,但不知道这个参数的设置标准是什么,要遵循什么原则,调压原理是什么,适合什么样的体系模拟?
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美元一起赚: http://usearn.5d6d.com/index.php
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lei0736

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★ ★ ★
suntao1982(金币+1,VIP+0):谢谢!欢迎常来计算模拟版!
gamma337(金币+1,VIP+0):哪里有你说的西北大学之music程序?
gamma337(金币+1,VIP+0):我邮箱:shungta@yahoo.cn。
去看看西北大学的MUSIC程序吧 好像有 不过认真看源代码
2楼2008-05-11 12:33:04
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sunnydragonfly

木虫 (小有名气)


gamma337(金币+1,VIP+0):你用的什么软件做的?
Andersen调压方法我也关注了好久,可就是不知道具体怎么实现,哪里可以下载到相关的原程序呢?我这里倒是有一个实现等压的小程序,利用调压系数调压的,也有相关的文献,但按照这个程序我总是会出问题,调不到预设的压强
3楼2008-05-11 14:52:42
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lei0736

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★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):3q
美国的西北大学 英文搜索MUSIC即可
4楼2008-05-12 22:27:26
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honghuzlj

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by sunnydragonfly at 2008-5-11 14:52:
Andersen调压方法我也关注了好久,可就是不知道具体怎么实现,哪里可以下载到相关的原程序呢?我这里倒是有一个实现等压的小程序,利用调压系数调压的,也有相关的文献,但按照这个程序我总是会出问题,调不到预设 ...

能不能将你的资料共享一下啊
我很想看看,能发给我看看么?zhaolongjiang@bit.edu.cn
谢谢
5楼2008-05-14 09:57:41
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honghuzlj

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by lei0736 at 2008-5-11 12:33:
去看看西北大学的MUSIC程序吧 好像有 不过认真看源代码

什么啊,那是所音乐学校啊,跟编程有什么关系?
6楼2008-05-14 10:12:33
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lei0736

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★ ★ ★ ★ ★
csfn(金币+3,VIP+0):3q
gamma337(金币+2,VIP+0):恩
DL-POLY好像也可以 其实能实现Andersen调压的程序很多
上次给的那个看错了 是Berendsen调压
MUSIC程序在这 http://zeolites.cqe.northwestern.edu/Music/music.html
DL-POLY很多地方可以下载 CCCP5里就有

同时提供一个能实现Andersen调压的小程序
http://www.pages.drexel.edu/~cfa22/msim/node44.html
7楼2008-05-14 10:41:07
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sunnydragonfly

木虫 (小有名气)

几天没登录小木虫了,我用的是FORTRAN语言写的程序,楼主,待会儿把那个小程序发到你的邮箱
8楼2008-05-14 19:41:08
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sunnydragonfly

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 呵呵 专家来了
还是加在附件里供大家分享吧,有兴趣的可以试试,有进展欢迎拿来分享 啊
由于不支持.f的文件,我将后缀改成了.txt
9楼2008-05-14 19:54:33
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abinitio

版主 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by sunnydragonfly at 2008-5-14 19:54:
还是加在附件里供大家分享吧,有兴趣的可以试试,有进展欢迎拿来分享 啊
由于不支持.f的文件,我将后缀改成了.txt

非常感谢!
10楼2008-05-14 20:50:55
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