应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 蒙脱石吸附，能量优化
52/1返回列表
查看: 1967  |  回复: 18
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

jhjh12

银虫 (小有名气)

[求助] 蒙脱石吸附，能量优化 已有2人参与

我构建了蒙脱石的结构模型，使用运用Sorption板向蒙脱石的双晶胞结构体系中添加水分子，形成一、二、三层水分子，水分子分层也不是很明显，然后用Discover模块进行能量优化，计算出最低能量构型，出现错误，不知道哪一步错了。一直做不出来来。

蒙脱石吸附，能量优化
二层


蒙脱石吸附，能量优化-1
一层


蒙脱石吸附，能量优化-2
三层


蒙脱石吸附，能量优化-3
能量最小化出现错误.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
坚持、努力、成功
1楼 2014-11-03 11:49:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

呀呀杨会苗

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by jackup at 2015-03-10 11:49:44
哦，那32个硅原子或8个铝原子中只要被取代原子不相邻，随便选择一个被取代就行吗？为什么我根据文献里的数据建立的晶胞，硅（铝）原子的总个数并不是32（8）的倍数，应该按照倍数向前或向后取整确定被取代原子的个 ...

建模可以从数据库中下载蒙脱石的文件，然后导入。要是自己建应该按照倍数吧，我记得文献里面提到了3个方向扩展几倍

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
13楼2015-03-11 12:21:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 19 个回答

呀呀杨会苗

铜虫 (初入文坛)
你好，怎么你的可以把水吸附进去，我用sorption就出错了。。。求助！！！多谢多谢呀。
蒙脱石吸附，能量优化-4
sorption.jpg


蒙脱石吸附，能量优化-5
出错.jpg
赞一下 回复此楼
2楼2015-01-09 09:29:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

芝麻小迪

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by 呀呀杨会苗 at 2015-01-09 09:29:01
你好，怎么你的可以把水吸附进去，我用sorption就出错了。。。求助！！！多谢多谢呀。

sorption.jpg

出错.jpg
...

你的加水失败应该看一下给出的失败的原因是啥，然后解决
赞一下 回复此楼
3楼2015-01-10 09:46:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

呀呀杨会苗

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 芝麻小迪 at 2015-01-10 09:46:41
你的加水失败应该看一下给出的失败的原因是啥，然后解决...

失败以后，下载的文件里面没有后缀为.out的文件…所以也不知道是怎么回事。多谢！

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
4楼2015-01-10 15:08:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 19 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 好奇怪的filecode +5 布布和一二 2026-08-08 6/300 2026-08-12 16:11 by 云上清扬
[基金申请] FileCode能看出啥？ +8 要乐观耀哥 2026-08-10 21/1050 2026-08-12 16:08 by 云上清扬
[基金申请] 长年满屏的广告，版主太不责任了。基金也等的急 +4 gltch 2026-08-12 4/200 2026-08-12 16:08 by eulota
[基金申请] filecode +13 documentary 2026-08-10 15/750 2026-08-12 15:56 by 云上清扬
[论文投稿] 职称评审，求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变，有变的大神么？ +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了，今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] 大家散了吧，后缀研究没有意义，别浪费时间了，过好目前的每一天，不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭