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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 【求助】分子动力学碰到的两个问题
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gamma337

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】分子动力学碰到的两个问题

我在用XMD 模拟界面扩散的时候，出现以下两个问题，请教原因和解决办法：

1.  Box mass may be too low.
Simulation may display unstable energy or other problems.

2. ERROR (TestCutoff): Potential cutoff distance (5.685132e+000 angs) exceeds half
             the minimum repeat boundary length (-15911114983234163000000000000000000.000000 angs)
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1楼 2008-05-07 14:55:24
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
盒子太小 可能是周期边界设置太小或者放的原子太少吧 导致截断半径大于盒子边长的一半 建近邻列表的时候就出错了
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4楼2008-05-07 21:54:00
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cuihang

铁杆木虫 (正式写手)

VASPer
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
第二个是截断半径太大，超过了周期性盒子的一般，把截断半径减小吧
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聪明人知道自己是傻子，傻子以为自己是聪明人
2楼2008-05-07 15:43:46
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yzhhlq_1983

木虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
个人觉得是同一问题,你的cutoff<0.5的模拟盒子边长,得符合最小镜象原则
赞一下(10人) 回复此楼
3楼2008-05-07 16:08:56
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