24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 464  |  回复: 6
当前主题已经存档。

zhangh1985

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】同源建模

老师给我了蛋白酶的英文名称,我在NCBI上搜了一下,有2000多条,我怎么找到我想要的啊,必须找到代码吗?我是个新手,问题简单,让大家见笑了
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luai071

木虫 (著名写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算模拟版!
找你所要做的种属的,如这个酶是人的,就找人的;要做同源模建还要去PDB里面查下已有晶体结构的同源蛋白,两者互相比较以确定到底用哪个序列
2楼2008-05-07 09:21:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sakata.wei


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算模拟版!
当你找到你要的酶后,上PDB找看是否有一样的晶体,
倘若没有表示你必须要做Homology Modeling,
可以利用Swiss-Port运行Homology Modeling,或是Sybyl、DiscoveryStudio运行
3楼2008-05-07 11:17:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jilinjohn

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
http://ca.expasy.org/sprot/
swiss-prot数据库,输入你的酶的名称,然后找到相应你要的酶,然后点击打开,里面有各个数据库的链接信息,如果没有PDB的结构,也就是PDB数据库的录入代号,那么你就可以模建了。当然你还要先搜搜看各个数据库这个酶是不是已经有人模件过了呵呵。
http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=696776&view=old
4楼2008-05-07 13:47:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangh1985

木虫 (小有名气)

哦,谢谢啊.
5楼2008-05-07 15:43:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

syhu_007012

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by jilinjohn at 2008-5-7 13:47:
http://ca.expasy.org/sprot/
swiss-prot数据库,输入你的酶的名称,然后找到相应你要的酶,然后点击打开,里面有各个数据库的链接信息,如果没有PDB的结构,也就是PDB数据库的录入代号,那么你就可以 ...

请教一下:
如何知道我的目标蛋白别人是否模建过呢?
如果别人模建过,那他的结果是否可以下载到呢?
6楼2008-05-07 19:12:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jilinjohn

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
to syhu:这个你只能去各大数据库搜索了,看这个蛋白是否已经被模建过并发表了,即以模件过,如果你跟它做的实验目的不一样,也没有关系呵呵。

这个貌似下载不了,只有极少数的模建见过被PDB数据库收录,你可以直接跟作者联系,跟他要他模建的结果呵呵
http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=696776&view=old
7楼2008-05-07 22:02:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhangh1985 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 云南大学材料与能源学院解琳课题组钙钛矿博士招生 +4 光伏爱好者 2026-05-17 6/300 2026-05-21 01:37 by 17520222914
[基金申请] 评审有感 +14 popular289 2026-05-18 23/1150 2026-05-20 17:39 by lincyb
[基金申请] 提交了我也来说说感想 +6 fummck 2026-05-20 6/300 2026-05-20 17:29 by 姜太公烤鱼
[论文投稿] Sci. Bull. 悲剧经验 +6 jyang1999 2026-05-16 7/350 2026-05-20 16:39 by feng6531
[基金申请] 今年审到国自然15份,谈谈感受 +19 国自然国社科中 2026-05-17 20/1000 2026-05-20 14:14 by 仲夏夜的星星
[基金申请] 国自然评分 +3 无名者登山 2026-05-20 4/200 2026-05-20 13:29 by vito刘
[考博] 如果工作了想读博,可以边工作边读全日制嘛? 30+3 铁达火车 2026-05-18 5/250 2026-05-20 09:33 by tfang
[基金申请] 河北省自然科学基金 +3 Peterchao 2026-05-18 3/150 2026-05-20 08:57 by 霸_霸
[教师之家] 上海大学实验技术岗位非升即走 +12 嘻嘻哈哈乐呵呵 2026-05-15 13/650 2026-05-20 08:34 by xli1984
[基金申请] 2026山东省优青 +3 luckinging 2026-05-14 4/200 2026-05-19 16:15 by 52wls
[考博] 找博士生导师 +6 小代想上岸 2026-05-15 7/350 2026-05-19 10:22 by free_fisher
[考博] 26/27申博自荐-锂/钠电池方向 5+3 狗头军师. 2026-05-15 4/200 2026-05-19 09:10 by moonboat
[基金申请] 同样的基金本子,换个专家直接从C变A! (金币-10) +3 国自然国社科中 2026-05-19 3/150 2026-05-19 08:50 by Equinoxhua
[考博] 2026博士还有哪些学校有名额 +7 小王求读研 2026-05-15 8/400 2026-05-19 08:27 by zhyzzh
[考博] 博士申请 +5 星…… 2026-05-18 6/300 2026-05-18 23:49 by 糊糊涂涂好
[基金申请] 国自然上会要求 +5 无名者登山 2026-05-18 9/450 2026-05-18 17:50 by BlakeReary
[文学芳草园] 半夜喝咖啡 +3 myrtle 2026-05-15 5/250 2026-05-18 01:03 by 小沈2018
[考博] 光量子物理方向 博士招生 1人(2026.09) +3 sandyworld 2026-05-15 4/200 2026-05-17 14:38 by sandyworld
[有机交流] 求助2,4-二氯-5-嘧啶甲醛的合成方法 20+3 光吃不拉 2026-05-14 6/300 2026-05-16 19:46 by Equinoxhua
[硕博家园] 申请博士 +3 呃?呃 2026-05-15 3/150 2026-05-16 11:01 by a4742549
信息提示
请填处理意见