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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 【求助】：关于autodock的可操作性
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hongemerson

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】：关于autodock的可操作性

需要使用autodock进行分子对接，但是我不清楚这个软件的具体有多大的可操作性。请问各位用的大大们，这个软件在本本上跑得起来吗？速度怎么样？如果需要比较高效的对接的话，对硬件的要求怎么样呢？

[ Last edited by lei0736 on 2008-5-11 at 14:24 ]
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1楼 2008-05-05 17:28:16
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cloudsea163

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
我觉得autodocK对计算机的要求并不高，只是它的辅助工具ADT图形界面在LUNIX下运行的时候好像很容易死机，反正我用的时候死机了好多次，不知道WINDOW下怎么样  呵呵 不过你可以用脚本来准备输入文件，只是ADT用起来更加方便  至于软家的可操作行，其实你查一下，就知道有很多人在用，当然它只能做一些比较粗略的计算，更多的是结合MD 模拟来对体系进行研究。
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路漫漫其修远兮，吾将上下而求索！
2楼2008-05-08 11:32:35
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chemhz

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
ADT在window下没有问题。 如果要做虚拟筛选，autodock的结果就可以接受的。如果更细致地考虑相互作用模式， 结合一些简单的MD更有说服力。
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3楼2008-05-08 18:38:58
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