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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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hongemerson

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】:关于autodock的可操作性

需要使用autodock进行分子对接,但是我不清楚这个软件的具体有多大的可操作性。请问各位用的大大们,这个软件在本本上跑得起来吗?速度怎么样?如果需要比较高效的对接的话,对硬件的要求怎么样呢?

[ Last edited by lei0736 on 2008-5-11 at 14:24 ]
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cloudsea163

金虫 (著名写手)

★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
我觉得autodocK对计算机的要求并不高,只是它的辅助工具ADT图形界面在LUNIX下运行的时候好像很容易死机,反正我用的时候死机了好多次,不知道WINDOW下怎么样  呵呵 不过你可以用脚本来准备输入文件,只是ADT用起来更加方便  至于软家的可操作行,其实你查一下,就知道有很多人在用,当然它只能做一些比较粗略的计算,更多的是结合MD 模拟来对体系进行研究。
路漫漫其修远兮,吾将上下而求索!
2楼2008-05-08 11:32:35
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chemhz

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
ADT在window下没有问题。 如果要做虚拟筛选,autodock的结果就可以接受的。如果更细致地考虑相互作用模式, 结合一些简单的MD更有说服力。
3楼2008-05-08 18:38:58
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