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clf0803

银虫 (正式写手)

[交流] 关于酶切!

各位虫友,最近实验很不顺利,请大家帮帮忙!
PCR纯化产物和质粒分别用NdeI和HindIII进行分别但酶切过夜,然后16度连接过夜,连接时做了自连的对照,转化至感受态细胞。因为我没有使用T载体,所以酶切那步我没办法检测。Amp+平板上都长出了菌落,自连的对照相对少一点,有目的基因的平板多一点,这似乎合乎情理,可问题就是不管我用菌落做PCR还是抽质粒都没有结果?大家说这是什么原因阿?
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bio830805

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
lixiaoyi1981(金币+3,VIP+0):个人的体会是最珍贵的,所以要鼓励一下
1.酶切那步可以做一下单酶切验证的,上样孔排序为表达载体质粒,Nde I单酶切,HindIII单酶切,一般单酶切结果可以从图上看出来,因为超螺旋质粒比线性化的跑的靠前。但PCR产物做酶切一般就没法验证了。所以一般建议用T载体连接后在酶切,其实用试剂盒只要一周时间就能做好了,效率很高的。
2.关于连接,其实可以做一下连接PCR验证,原理和菌落一样,只不过用稀释连接液替代菌落,反应体系可以见pET表达系统手册。一般连接PCR验证没问题的话接下去做转化信心可以大增。另外有人建议在连接前增加加热步骤可以提高连接效率,这个可以参考以下链接:
http://www.protocol-online.org/p ... ting-step-2601.html
3.转化的时候做自连对照是必要的,不过一般转化时候出现问题是比较少见的。以前我做的时候其实自连长得菌落也不少,还有就是LB/Amp平板上生长的话一般不要超过两天,不然会有卫星菌落出现,要挑大个的,而不是周围小个的那些。如果你觉得转化不放心,还可以增加一个空宿主菌的对照。
总体来说,酶切和连接出现问题的可能性最大,而且酶切回收的DNA片段浓度一定足够,否则连接效率不高的话,很容易导致连接失败,或筛选不到正确的重组子。
个人的一些经验,呵呵
不会跳舞的外语达人不是好生物学家
2楼2008-05-05 16:03:57
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26633369

金虫 (小有名气)

★
lixiaoyi1981(金币+1,VIP+0):很有可能的,谢谢了。
我觉得可能是因为没有连接T载体,PCR产物少很多都没有转染到感受态细胞中,挑的是假阳性斑,以至于在于最后菌落的鉴定没结果。我提议你最好不要嫌麻烦把PCR产物连接到T载体上,一步一步做一步一步鉴定,就能找到问题。
3楼2008-05-05 16:04:49
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clf0803

银虫 (正式写手)

请问T载体怎么选择阿?和酶切位点有关系吗?
4楼2008-05-05 20:22:36
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superwheat

银虫 (正式写手)

如果你的引物自带了酶切位点,那就随便挑一个公司的好了
资金充足的话,NEB的产品都很好的
如果想节省一点,TAKARA和天根的还不错
5楼2008-05-06 00:02:55
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xutian32

金虫 (小有名气)

我用的T载体是宝生的,效果很不错,建议楼主可以一试。并且载体的处理很重要,酶切要完全,连接的可能性才会大些。
6楼2008-05-06 11:19:04
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clf0803

银虫 (正式写手)

我的引物自带NdeI和HindIII,应该选择什么T-载体?
7楼2008-05-06 14:39:31
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