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牛哥哥

铜虫 (著名写手)

懒牛

[交流] 怎么利用PCR技术定向插入一段DNA序列?

怎么利用PCR技术定向插入一段DNA序列?
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哞```````````````````````````````````````````
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seahow

木虫 (著名写手)

lixiaoyi1981(金币+0,VIP+0):说得详细一些,分步骤,是有分加的。呵呵,好人做到底嘛。
easy, 设计引物,二次PCR,但是需要高保真
2楼2008-05-05 11:04:57
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humants

金虫 (正式写手)

可以在引物设计时引入限制酶位点。当DNA片段两端为非同源的粘性末端时,可实现定向克隆,这时的连接效率非常高,是重组方案中最有效、简捷的途径.

由于PCR引物的5'末端可以增加一些非互补碱基,因此可以在两引物的5'末端设计单限制酶或双限制酶切位点。这样得到的PCR产物用限制酶消化产生粘性末端,即可与有互补粘端的载体DNA重组。这种克隆方法效率较高,且当两引物中设计不同酶切位点时,可有效地定向克隆PCR产物。其缺点是需要加长PCR引物,除限制酶识别序列外,还需要在其5'端多合成3-4个碱基以利于限制性内切酶与PCR产物末端的稳定结合。即使如此,其酶切效率也不够高。其中尤以NotI、XhoI和XbaI等较为难切。采用突变PCR方法可克服上述缺点。该方法是通过在两PCR引物序列中改变1至数个核苷酸创造出一个限制性内切酶位点。鉴于PCR引物的3'末端序列的互补性是PCR成功的关键,在PCR引物的中部或近5'端改变1个或几个碱基对PCR扩增效果影响不大。这种方法不需要增加PCR引物的长度,而且酶切效果优于5'加端法。对于特定DNA片段的克隆,此方法较为经济、实用。但对于基因诊断PCR产物的克隆,似乎5'加端法更为适宜。 T4DNA聚合回切产生粘端:如PCR两引物的5'末端是A或T,则可在其5'端分别加上CG和CCGG。用此二引物扩增的PCR产物在dATP和dTTP存在的情况下,用T4DNA聚合酶进行处理,则T4DNA聚合酶因具有3'→5'外切酶活性而消去3'末端的G和C,产生AccI和XmaI粘性末端(图1)。此DNA片段直接与用AccI和XmaI切开的载体进行连接。这种方法只需在PCR引物的5'端加2-4个碱基,但其可选择的限制酶类有限。

以上内容摘自genecool。下面的连接中讲了很多关于PCR和基因定向克隆。http://www.genecool.com/bbs/thread-8142-1-1.html
希望能给你帮助。
l
3楼2008-05-05 18:24:43
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seahow

木虫 (著名写手)

★ ★
lixiaoyi1981(金币+2,VIP+0):鼓励一下ixie,这样他可能会明白一些。求助者可能是刚刚涉及这个方面,自然要说得明了一些。
版主说我说的不彻底,我就说一下,我表达能力一般

引物这样设计(note:本实验不涉及到内切酶的应用,本人实验室已经很久不用内切酶做克隆了,呵呵) 引物包括两部分一是您的目的片段的两端,另一部分是要插入的部分的两端。 所以,PCR也是做两次,首先第一个PCR扩增你的目的片段,第二次PCR,插入你的片段, 有一点你需要注意:用pfu酶,不要用普通taq。
4楼2008-05-06 21:08:04
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