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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 网络生活区 » 有奖问答 » 学术帮助 » 径向分布函数（g(r)）量化MD模拟中第一层溶剂中水分子的个数
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yuanhy

金虫 (小有名气)

[求助] 径向分布函数（g(r)）量化MD模拟中第一层溶剂中水分子的个数

各位大虾：
       我是做有机反应机理的，最近投篇稿，要求做MD模拟。但审稿意见回来让给出” radial distribution function g(r) to quantify how many water molecules are in the first solvation shell of the reactive center in average“。本人对动力学模拟不熟，上次MD模拟也是求别人给算的。不知哪位大虾懂径向分布函数量化内层水分子个数，希望能尽快帮助我，在此先谢谢！
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夏虫不可语于冰
1楼 2014-10-22 08:52:40
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潇湘小虎

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
2楼2014-11-07 08:54:05
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chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

好像是算一下径向分布好书第一峰值前面的区域中水分子的个数吧，水合数目。
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3楼2014-11-09 09:42:15
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176286641cc

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

对离子-水分子径向分布函数积分至第一峰谷位可求出该离子的第一配位层配位数
不知道是不是你要的量化内层水分子数。。。
（这个帖子貌似应该很久了）
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小虫期待破茧成蝶！
4楼2015-04-14 15:16:22
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