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小虫虫LG

木虫 (正式写手)

[求助] phonopy怎么看eigenvector 已有1人参与

文件里面写的格式看不懂，请高手指点啊
下面是我算的NaCl，
每个原胞两个原子。下面atom1，2各自三个中括号到底怎么解读？atom1,2之间什么关系呢？
nqpoint: 204   
npath: 4      
natom: 2      
reciprocal_lattice:
- [  -0.17618119,   0.17618119,   0.17618119 ] # a*
- [   0.17618119,  -0.17618119,   0.17618119 ] # b*
- [   0.17618119,   0.17618119,  -0.17618119 ] # c*
phonon:
- q-position: [    0.0000000,    0.0000000,    0.0000000 ]
  distance:    0.0000000
  band:
  - # 1
    frequency:   -0.0489099600
    eigenvector:
    - # atom 1
      - [ -0.00000000000000,  0.00000000000000 ]
      - [  0.61756401446499,  0.00000000000000 ]
      - [ -0.15123058551995,  0.00000000000000 ]
    - # atom 2
      - [  0.00000000000000,  0.00000000000000 ]
      - [  0.74969321650068,  0.00000000000000 ]
      - [ -0.18358670750911,  0.00000000000000 ]
  - # 2
    frequency:   -0.0489099600
    eigenvector:
………………………………
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1楼 2014-10-21 11:47:02
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

hn19870519

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小虫虫LG: 金币+30, ★★★很有帮助, 非常感谢！ 2014-10-21 13:57:08
atom1 atom2就是你最开始的POSCAR（没有扩包）中的atom1 atom2
eigenvector:
    - # atom 1
      - [ -0.00000000000000,  0.00000000000000 ]
      - [  0.61756401446499,  0.00000000000000 ]
      - [ -0.15123058551995,  0.00000000000000 ]
三个括号分别代表三个方向的原子位移。我请教了别人，他告诉我说左边是实部，右边是虚部。用实部的数据就可以。如果要给初始POSCAR原子加位移，最好乘以一个系数，比如0.01，具体要测试。
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2楼2014-10-21 13:19:21
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小虫虫LG

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hn19870519 at 2014-10-21 13:19:21
atom1 atom2就是你最开始的POSCAR（没有扩包）中的atom1 atom2
eigenvector:
    - # atom 1
      -
      -
      -
三个括号分别代表三个方向的原子位移。我请教了别人，他告诉我说左边是实部，右边是虚 ...

非常感谢你的回复！我还有疑问想请教你一下，那就是如何通过eigenvector判断哪些声子属于同一频支？或者说，某个q点的某个频率，属于横波或者纵波？
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3楼2014-10-21 14:05:47
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hn19870519

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小虫虫LG at 2014-10-21 14:05:47
非常感谢你的回复！我还有疑问想请教你一下，那就是如何通过eigenvector判断哪些声子属于同一频支？或者说，某个q点的某个频率，属于横波或者纵波？...

不好意思。我也是才开始接触。
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4楼2014-10-21 19:42:01
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小虫虫LG

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by hn19870519 at 2014-10-21 19:42:01
不好意思。我也是才开始接触。...

再问你一个额外的问题好吗，我在算石墨烯的时候，发现Gamma点有虚频，怎么办呢？
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5楼2014-10-23 10:03:00
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hn19870519

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小虫虫LG at 2014-10-23 10:03:00
再问你一个额外的问题好吗，我在算石墨烯的时候，发现Gamma点有虚频，怎么办呢？...

几个办法：增大超包；增加K点和ENCUT。我测试silicene的时候发现超包是奇数和偶数的时候会不同。你测试的时候也可以注意一下
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6楼2014-10-23 10:35:57
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小虫虫LG

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hn19870519 at 2014-10-23 10:35:57
几个办法：增大超包；增加K点和ENCUT。我测试silicene的时候发现超包是奇数和偶数的时候会不同。你测试的时候也可以注意一下...

是这样的，我为了计算格林艾森参数，需要将晶格常数在平衡位置适当扩大或者缩小以得到改变体积之后的声子谱。结果发现缩小晶格常数（是原来的0.98倍）之后Gamma点出现了虚频，平衡位置没有虚频。扩胞是441，encut都增加到950，k点是11 11 1
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7楼2014-10-23 10:49:11
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hn19870519

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 小虫虫LG at 2014-10-23 10:49:11
是这样的，我为了计算格林艾森参数，需要将晶格常数在平衡位置适当扩大或者缩小以得到改变体积之后的声子谱。结果发现缩小晶格常数（是原来的0.98倍）之后Gamma点出现了虚频，平衡位置没有虚频。扩胞是441，encut都 ...

那是不是本身就会有虚频呢。
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8楼2014-10-23 14:34:06
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1173149197

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小虫虫LG at 2014-10-21 14:05:47
非常感谢你的回复！我还有疑问想请教你一下，那就是如何通过eigenvector判断哪些声子属于同一频支？或者说，某个q点的某个频率，属于横波或者纵波？...

楼主，请问您现在知道怎么判断了吗？判断哪些声子属于同一频支，尤其是在不通的q点的判断。谢谢！
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9楼2016-01-11 19:04:34
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busstop

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
10楼2016-01-11 23:44:39
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