24小时热门版块排行榜    

查看: 953  |  回复: 1

海韵315

银虫 (小有名气)

[求助] CPMD 画图

本人刚开始用CPMD,看手册里有画图的部分,一个都弄不出来啊,望行家指教!!
1:xmgrace是怎么用的啊?我下载好了,安装了打开后不知道怎么把数据导进去,坐标怎么改?需要把数据弄成什么格式才能导入呢?
2:在day2 中有一句“We use the program gx.x that reads the TRAJEC.xyz file and calculated the RDF. Just running the program prints a description of the input file. Compare this we the provided input file gofrin. Now run the program    gx.x gofrin "这是什么意思啊?gx.x是干什么用的?怎么利用gofrin画TRAJEC.xyz的图呢?
3:cpmd2cube.x是用来把文件转换成cube或pdb格式,再在molekel里画图的,但这个cpmd2cube.x这个可执行文件是怎么产生的呢?这个压缩文件我是有的。

再次感谢大家啊!!!
回复此楼
新的人生从此开始
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

xmgrace 是在linux下的一个画图软件,是在xwindows界面下的,使用ssh远程登录方式只能使用命令行格式。在图形界面上,打开xmgrace后,在data-import处可以导入文本文件,也就是坐标文件。

关于day2中的gx.xy文件,应该是和cpmd2cube一样,是cpmd带的小工具程序?如果是,也需要编译
2楼2014-12-19 14:54:44
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 海韵315 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +3 困于星晨 2026-03-17 3/150 2026-03-17 14:08 by ms629
[考研] 301求调剂 +3 yy要上岸呀 2026-03-17 3/150 2026-03-17 14:04 by laoshidan
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +15 不知道叫什么! 2026-03-15 17/850 2026-03-17 10:13 by Sammy2
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +7 邱gl 2026-03-11 8/400 2026-03-17 09:36 by 努力学习赚彩礼
[考研] 301求调剂 +3 A_JiXing 2026-03-16 3/150 2026-03-17 08:21 by 无际的草原
[考研] 环境工程调剂 +6 大可digkids 2026-03-16 6/300 2026-03-16 17:16 by barlinike
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
[考研] 0703化学调剂 +6 妮妮ninicgb 2026-03-15 9/450 2026-03-16 16:40 by houyaoxu
[考研] 283求调剂 +10 小楼。 2026-03-12 14/700 2026-03-16 16:08 by 13811244083
[考研] 312求调剂 +3 陌宸希 2026-03-16 4/200 2026-03-16 15:06 by peike
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[考研] 0805,333求调剂 +3 112253525 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:42 by JourneyLucky
[考研] 332求调剂 +3 zjy101327 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:48 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工求调剂一志愿 985 总分 295 +8 dream…… 2026-03-12 8/400 2026-03-13 22:17 by 星空星月
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 【0856】化学工程(085602)313 分,本科学科评估A类院校化学工程与工艺,诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:06 by ruiyingmiao
[考研] 295求调剂 +3 小匕仔汁 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:17 by vgtyfty
[考研] 26考研求调剂 +5 丶宏Sir 2026-03-13 5/250 2026-03-13 13:05 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 资源与环境 285 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:31 by houyaoxu
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生,2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
信息提示
请填处理意见