24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 965  |  回复: 1

海韵315

银虫 (小有名气)

[求助] CPMD 画图

本人刚开始用CPMD,看手册里有画图的部分,一个都弄不出来啊,望行家指教!!
1:xmgrace是怎么用的啊?我下载好了,安装了打开后不知道怎么把数据导进去,坐标怎么改?需要把数据弄成什么格式才能导入呢?
2:在day2 中有一句“We use the program gx.x that reads the TRAJEC.xyz file and calculated the RDF. Just running the program prints a description of the input file. Compare this we the provided input file gofrin. Now run the program    gx.x gofrin "这是什么意思啊?gx.x是干什么用的?怎么利用gofrin画TRAJEC.xyz的图呢?
3:cpmd2cube.x是用来把文件转换成cube或pdb格式,再在molekel里画图的,但这个cpmd2cube.x这个可执行文件是怎么产生的呢?这个压缩文件我是有的。

再次感谢大家啊!!!
回复此楼

» 猜你喜欢

新的人生从此开始
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

xmgrace 是在linux下的一个画图软件,是在xwindows界面下的,使用ssh远程登录方式只能使用命令行格式。在图形界面上,打开xmgrace后,在data-import处可以导入文本文件,也就是坐标文件。

关于day2中的gx.xy文件,应该是和cpmd2cube一样,是cpmd带的小工具程序?如果是,也需要编译
2楼2014-12-19 14:54:44
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 海韵315 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料调剂 +14 一样YWY 2026-04-06 14/700 2026-04-08 23:00 by 猪会飞
[基金申请] 有爆料,一个青年教师卖房得400万,然后换了一个四青帽子 +5 babu2015 2026-04-08 5/250 2026-04-08 22:23 by god_tian
[考研] 材料与化工专硕306分找合适调剂 +27 沧海轻舟e 2026-04-06 28/1400 2026-04-08 22:06 by wdyheheeh
[考研] 266调剂 +8 daya sun 2026-04-07 9/450 2026-04-08 20:27 by yutian743
[考研] 283求调剂 +19 A child 2026-04-04 19/950 2026-04-08 14:26 by xingguangj
[考研] 285求调剂 +18 AZMK 2026-04-02 19/950 2026-04-08 10:33 by xingguangj
[考研] 277、学硕,求调剂 数一104, +11 瓶子PZ 2026-04-07 12/600 2026-04-07 23:30 by 一只好果子?
[考研] 调剂 +4 mcbbc 2026-04-06 5/250 2026-04-07 12:33 by upczlm1989
[考研] 考研调剂 +7 15615482637 2026-04-04 7/350 2026-04-06 22:56 by chenzhimin
[考研] 269电子信息求调剂,可转专业 +5 独酌wl 2026-04-06 5/250 2026-04-06 17:23 by 土木硕士招生
[考研] 一志愿国科大信工所,英二数二408总分293分求调剂 +3 ilcyuan 2026-04-02 4/200 2026-04-06 16:35 by likeihood
[考研] 调剂 一志愿吉林大学357分 +5 .Starry. 2026-04-04 5/250 2026-04-06 09:28 by cql1109
[考研] 262求调剂 +7 天下第一文 2026-04-04 8/400 2026-04-05 21:31 by 激流勇渡
[考研] 315求调剂 +5 &123456789 2026-04-05 5/250 2026-04-05 19:55 by nepu_uu
[考研] 一志愿9材料学硕297已过六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-04-04 12/600 2026-04-05 19:04 by 蓝云思雨
[考研] 313求调剂 +5 海日海日 2026-04-04 7/350 2026-04-05 13:58 by imissbao
[考研] 295求调剂 +4 A你好研究生 2026-04-04 5/250 2026-04-04 22:46 by yu221
[考研] 085701求调剂 +7 龚禹铭 2026-04-04 8/400 2026-04-04 13:49 by 小小树2024
[考研] 求调剂 +3 心想事成可 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:22 by wangjy2002
[考研] 293求调剂 +4 珂珂乐 2026-04-02 4/200 2026-04-02 20:10 by 6781022
信息提示
请填处理意见