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ritchiejin

铜虫 (初入文坛)

[求助] Q-TOF做小肽测序 已有1人参与

求助各位虫友,本人刚接手bruker的Q-TOF,现在在做一个小肽测序的工作,分子量为1208左右,MS和MS/MS质量范围均设置为50~1500m/z,我发现MS结果很好,有和预期一样的[M+H]+和双电荷的605峰,但是做MS/MS或者用MRM隔离出605时,二级质谱200m/z以下是没有信号的,但是我的N端有两个氨基酸质量和在200以下,现在看不到峰了,没办法完成测序,我该怎么办呢?
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JLU_chem_man

新虫 (正式写手)

质谱蛋白质学习者

从数据分析的角度来看,b2离子看不到,你找相应的yn-2,yn-1离子。
从仪器的角度来看碎裂池和质谱分析器的一些关键参数需要优化,但是难度略大,质量范围略宽...
努力奋斗!!!
3楼2014-10-20 11:58:57
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chairman国家

捐助贵宾 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
MSMS的碰撞电压,锥孔电压,需要进一步优化,
2楼2014-10-19 14:08:24
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