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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 分析 » 质谱分析 » Q-TOF做小肽测序
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ritchiejin

铜虫 (初入文坛)

[求助] Q-TOF做小肽测序 已有1人参与

求助各位虫友，本人刚接手bruker的Q-TOF，现在在做一个小肽测序的工作，分子量为1208左右，MS和MS/MS质量范围均设置为50~1500m/z,我发现MS结果很好，有和预期一样的[M+H]+和双电荷的605峰，但是做MS/MS或者用MRM隔离出605时，二级质谱200m/z以下是没有信号的，但是我的N端有两个氨基酸质量和在200以下，现在看不到峰了，没办法完成测序，我该怎么办呢？
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1楼 2014-10-19 12:57:37
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JLU_chem_man

新虫 (正式写手)

质谱蛋白质学习者
从数据分析的角度来看，b2离子看不到，你找相应的yn-2，yn-1离子。
从仪器的角度来看碎裂池和质谱分析器的一些关键参数需要优化，但是难度略大，质量范围略宽...
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努力奋斗！！！
3楼2014-10-20 11:58:57
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chairman国家

捐助贵宾 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
MSMS的碰撞电压，锥孔电压，需要进一步优化，
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2楼2014-10-19 14:08:24
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