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山西小愚

银虫 (初入文坛)

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注册: 2012-11-04
性别: MM
专业: 环境微生物学

[求助] 多样性的进化树图奇葩，求助大神帮忙！

这是一个区域细菌多样性的进化树的一部分。克隆序列是已经去除一样的后EZ比对完mega6.0 建树的。计算方法也是没错的，NJ方法，bootstrap 1000 ; kimura2-parameter model,可是一些菌还是聚到了一起而没有和相似菌分到一起。哭了整个！求指点！从上到下分别是01、02、03的顺序！

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1楼 2014-10-16 09:12:08

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peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 65 (初中生)
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注册: 2007-06-08
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专业: 微生物生态学

【答案】应助回帖

这是mega做树的常见现象，如果是16S rRNA，建议楼主试试ARB软件

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2楼2014-10-17 15:58:35

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