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山西小愚

银虫 (初入文坛)

[求助] 多样性的进化树图奇葩,求助大神帮忙!

这是一个区域细菌多样性的进化树的一部分。克隆序列是已经去除一样的后EZ比对完mega6.0 建树的。计算方法也是没错的,NJ方法,bootstrap 1000 ; kimura2-parameter model,可是一些菌还是聚到了一起而没有和相似菌分到一起。哭了整个!求指点!从上到下分别是01、02、03的顺序!

多样性的进化树图奇葩,求助大神帮忙!
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多样性的进化树图奇葩,求助大神帮忙!-2
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peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

这是mega做树的常见现象,如果是16S rRNA,建议楼主试试ARB软件
2楼2014-10-17 15:58:35
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