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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】关于过渡态全优化的一个问题
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yiyayi

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于过渡态全优化的一个问题

在用QST2/QST3方法寻找过渡态时，发现程序给出的过渡态结构是在全优化计算的，能否使过渡态中的某些原子的坐标是固定的吗？我是做表面吸附计算的。
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CAS
1楼 2008-04-30 22:02:39
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liliracial

银虫 (小有名气)
★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):节日快乐！
可以的，将你不需要优化的原子坐标固定，就行了。
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修炼成一块愚钝的大石头
2楼2008-04-30 22:06:54
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yiyayi

金虫 (正式写手)
怎么固定呢？初始的过渡态结构是程序根据输入的反应物和产物的结构猜测出来的，在输入文件中没有对应的结构，如何固定呢？多谢！
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CAS
3楼2008-04-30 22:55:06
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)
没有对应的结构？哪如何计算？初始结构应该是有的，如果是用高斯计算，将要固定的原子或键后面加上“F”，将其冻结即可。
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4楼2008-05-01 19:16:49
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yiyayi

金虫 (正式写手)
用高斯QST2方法寻找过渡态，需要输入反应物和产物的构型参数，计算执行后，程序会根据输入反应物和产物的构型自动给出一个猜测的过渡态的初始猜测结构，之后程序就会对这个猜测的过渡态的初始猜测结构进行全优化计算，是否有办法对这个过渡态结构的某些结构参数固定呢，我是做表面吸附的，希望把矿物表面结构固定，多谢
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CAS
5楼2008-05-01 22:26:30
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xiaoboy185

金虫 (正式写手)
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎继续关注计算模拟版！
当计算开始时候不久你的初始构型就已经出来了，就一个ts构型
你可以看看能不能将这个构型加以部分固定 在进行ts found
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6楼2008-05-05 15:14:20
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yiyayi

金虫 (正式写手)
这个办法我已经试过了，但是太复杂了，很长时间还是没有优化出来。谢谢!
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CAS
7楼2008-05-06 10:39:32
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