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hongkaichen

金虫 (小有名气)

[交流] 求助!关于PCR的。

我想问下P出这样的图是由什么原因引起的,老P不出来,我的加样情况是:DNA 1ul ,引物 1ul ,mgcl2 3ul,buffer 5ul,tag 0.5ul.
设置程序是:
94 5-10min
94 1 min
50-54 1-2min
72  1-2min
cycle 30
72 5min
8  保存
做了好多次,上面的1-2,是指有1min和2min都做过,50度到54度也做过,开始还P出来过一点好淡的带,现在一点都没了,请各位给予指教!
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xiaoli8609

银虫 (小有名气)

引物浓度太高了吧,再或者就是模板质量不太好
4楼2008-04-29 18:24:44
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查看全部 6 个回答

shuwenying

铁虫 (小有名气)

参考意见

首先,上面那块胶是否有加marker?如果加了marker,但是现在看来连marker都没有,这么说可能就是电泳的问题。下方那块小胶,左边的是Marker吗? 如果是的话,marker就没有跑好,电泳的效果就不好,所以首先要确定是否是电泳操作的问题。电泳缓冲液、制胶和电压等操作细节务必注意。

请问“退火温度50-54 1-2min”,具体如何调整这个范围的?请问这个退火温度是如何确定的,能给出你的引物序列吗?以及产物片段多少bp? 下图有非特意扩增条带,我曾经试过退火温度不适合,就出现了以上情况,退火温度的选择应根据文献报道,如果是自己设计的引物,就从比引物的Tm值低5度开始试验,每次提高2度,然后根据条带结果再细致调整。

上面一幅图,呈现明显的非常模糊的带型。目的产物条带呈不清晰的成片条带,一般可能是引物浓度不合适和Mg2+浓度不合适,造成无效延伸。你只给出了加入MgCl2的体积,但是总的反应体积是?Mg2+的浓度是很重要的。通过建立降落PCR系列试验,摸索最佳镁离子浓度的水平

只是我自己的一点经验,有不足之处还希望指正^_^
2楼2008-04-29 17:18:19
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everbeen

木虫 (小有名气)

模板质粒还是cDNA?从基因组扩很容易smear。
3楼2008-04-29 17:55:03
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greenspringmi

银虫 (正式写手)

第一块胶看起来好像是反应液里用东西污染了,建议做个对照看看
你的胶跑的不是很好,把电泳的缓冲液换成新的,再来跑个看看吧
5楼2008-04-30 08:21:19
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